小儿结膜炎有眼部症状如结膜充血（不同类型表现略有差异）、分泌物增多（因病因不同性质有别），有眼部不适症状如异物感、畏光，还有全身伴随症状，感染性结膜炎可能发热，病毒感染引起的可能伴呼吸道症状，新生儿淋菌性结膜炎有全身中毒症状，过敏性结膜炎小儿可能伴皮肤过敏表现。
分泌物增多：根据病因不同分泌物性质有差异。细菌性结膜炎常出现较多脓性分泌物，早晨起床时可能会发现眼睑被分泌物粘住；病毒性结膜炎分泌物多为水样或浆液性；过敏性结膜炎分泌物多为黏稠丝状。例如，有研究显示，在儿童细菌性结膜炎患者中，约80%会出现明显的脓性分泌物。
眼部不适症状
异物感：患儿会感觉眼睛里有东西，不停地揉眼等以试图缓解这种不适感觉；还可能出现畏光现象，在光线较亮的环境下眼睛会不自主地眯起或者流泪，这是因为炎症刺激了眼部的感觉神经，导致眼部敏感性增加。
全身伴随症状
发热：某些感染性结膜炎可能伴有发热症状，比如病毒性结膜炎，尤其是由腺病毒引起的流行性角结膜炎，儿童可能会出现不同程度的发热，体温可在38℃~39℃左右，这是身体对病毒感染的免疫反应表现。
呼吸道症状：如果是由病毒感染引起的结膜炎，有时可能伴随呼吸道症状，如流涕、咳嗽等，像流感病毒引起的结膜炎可能会同时出现上呼吸道感染的相关症状，这是因为病毒通过呼吸道侵入人体后，同时累及眼部和呼吸道黏膜。
其他：对于新生儿淋菌性结膜炎，除了眼部明显的充血、分泌物增多外，还可能伴有全身中毒症状，如拒食、精神萎靡等，这是由于淋球菌感染后引起的全身性反应。而对于过敏性结膜炎的小儿，可能还会伴有皮肤过敏表现，如湿疹等，因为过敏体质是全身性的，眼部接触过敏原后引发眼部过敏反应的同时，可能身体其他部位也会出现过敏相关表现。
