卵巢囊肿的成因包括生理性因素如卵泡囊肿、黄体囊肿，病理性因素如子宫内膜异位囊肿（与经血逆流等有关，可致痛经等）、炎症性囊肿（输卵管卵巢脓肿由盆腔炎症引起，浆液性或黏液性囊腺瘤与上皮细胞异常增生有关），还有内分泌因素（内分泌激素紊乱如多囊卵巢综合征可致卵巢囊肿）、生活方式因素（长期不良生活方式影响内分泌致卵巢囊肿风险增加）、遗传因素（部分卵巢囊肿具遗传倾向）。
一、生理性因素
（一）卵泡囊肿
正常情况下，卵巢在排卵后会形成黄体，若卵泡未破裂或持续生长，就可能形成卵泡囊肿。女性每个月经周期都会有卵泡发育，一般优势卵泡成熟后排卵，若卵泡没有正常排卵，继续生长就可能形成直径1-3厘米左右的卵泡囊肿，多数情况下会在月经来潮后自行消失，常见于生育年龄的女性，与正常的月经周期中卵泡发育及排卵过程相关。
（二）黄体囊肿
黄体是排卵后由卵泡迅速转变成的富有血管的腺体样结构。如果黄体血肿吸收不彻底，或者黄体持续存在，就会形成黄体囊肿。一般直径在3厘米左右，偶尔可更大。多发生在月经周期的后半期，部分女性可能无明显症状，少数可能因囊肿破裂出现腹痛等表现，常见于有正常月经周期的女性，与黄体形成及消退的生理过程异常有关。
二、病理性因素
（一）子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
1.发病机制：子宫内膜组织出现在卵巢上，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊肿内含有类似巧克力样的暗褐色黏稠液体。子宫内膜异位症的发生与经血逆流、免疫因素、遗传因素等有关。育龄期女性是高发人群，尤其是有过人工流产、剖宫产等宫腔操作史，或者有家族遗传倾向的女性，经血逆流至盆腔，种植在卵巢表面并生长，逐渐形成囊肿。
2.特点：囊肿大小不一，可逐渐增大，会引起痛经、月经不调、不孕等问题，且复发率相对较高。
（二）炎症性囊肿
1.输卵管卵巢脓肿：多由盆腔炎症引起，细菌等病原体感染输卵管、卵巢，导致两者粘连形成脓肿。常见于性活跃的生育期女性，有不洁性生活史、多个性伴侣等情况增加发病风险。病原体上行感染，累及输卵管和卵巢，引发炎症反应，炎性渗出物积聚形成囊肿，患者常伴有下腹痛、发热、阴道分泌物增多等症状。
2.卵巢浆液性或黏液性囊腺瘤：属于卵巢的上皮性肿瘤，具体发病原因尚不完全明确，可能与卵巢上皮细胞异常增生有关。浆液性囊腺瘤多为单房，囊壁薄，囊内为清亮浆液；黏液性囊腺瘤多为多房，囊内为黏液样物质。可发生于任何年龄，以育龄女性多见，肿瘤逐渐生长，一般早期无明显症状，增大后可能出现腹部包块、腹胀等表现。
三、其他因素
（一）内分泌因素
过多的雄激素等内分泌激素紊乱可能影响卵巢的正常功能，导致卵巢囊肿形成。比如多囊卵巢综合征患者，常存在内分泌失调，表现为雄激素水平升高、排卵障碍等，同时伴有卵巢多囊样改变，可形成多个小囊肿。这类患者多有月经不调、不孕、多毛、肥胖等表现，与内分泌系统的功能紊乱密切相关。
（二）生活方式因素
长期的不良生活方式，如长期熬夜、精神压力过大等，可能影响内分泌系统的平衡，进而影响卵巢功能，增加卵巢囊肿的发生风险。长期熬夜会打乱人体的生物钟，影响激素的正常分泌节律；精神压力过大可通过神经内分泌系统影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，导致激素分泌异常，从而影响卵巢的正常生理过程，增加囊肿形成的可能性。
（三）遗传因素
部分卵巢囊肿具有一定的遗传倾向。例如某些遗传性肿瘤综合征可能增加卵巢囊肿的发病风险，如BRCA1/BRCA2基因突变与卵巢癌等相关，而卵巢癌患者可能伴有卵巢囊肿样病变。有家族中有亲属患有相关遗传性肿瘤疾病的人群，其发生卵巢囊肿的风险相对较高，需要更加密切地进行监测。
