有胎心后胎停的原因包括染色体异常（胚胎本身染色体数目或结构异常、年龄和生活方式影响染色体）、母体因素（内分泌异常如甲状腺功能和糖尿病异常、免疫因素如自身免疫病和免疫耐受异常、子宫异常如解剖结构和内膜病变）、胎盘因素（胎盘发育异常和早剥）、感染因素（TORCH感染影响胎儿发育致胎停）。
年龄因素影响：女性年龄越大，卵子质量越容易下降，染色体发生异常的概率就越高。例如，35岁以上的孕妇，胎儿染色体异常的发生率明显高于年轻孕妇。这是因为随着年龄增长，卵子在体内停留时间较长，受到各种不良因素影响的机会增加，容易发生染色体畸变。男性年龄过大时，精子的质量也会下降，染色体异常的概率也会升高，从而增加胚胎有胎心后胎停的风险。
生活方式影响：长期接触放射性物质、化学毒物等，会增加染色体异常的风险。比如长期处于含有苯、甲醛等有害化学物质的环境中工作或生活的人群，其生育的胚胎发生染色体异常的可能性增大，进而容易出现有胎心后胎停的情况。另外，长期吸烟、酗酒的人群，烟草中的尼古丁、酒精等成分会对生殖细胞造成损害，导致染色体异常，增加胚胎发育异常的风险。
母体因素
内分泌异常：
甲状腺功能异常：甲状腺激素对胚胎的生长发育至关重要。如果孕妇甲状腺功能减退，体内甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的生长发育，增加有胎心后胎停的风险。研究发现，甲状腺功能减退的孕妇发生胎停育的概率比甲状腺功能正常的孕妇高。而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎的正常发育过程，导致有胎心后胎停。
糖尿病：患有糖尿病的孕妇，如果血糖控制不佳，高血糖环境会影响胚胎的发育。高血糖可导致胚胎细胞外液渗透压升高，引起细胞脱水，影响胚胎的正常代谢和生长，增加有胎心后胎停的发生几率。而且糖尿病还可能引起血管病变，影响胎盘的血液供应，进一步影响胚胎的营养供应，导致胎停。
免疫因素：自身免疫性疾病患者，如系统性红斑狼疮等，体内存在自身抗体，这些抗体可能会攻击胚胎，影响胚胎的正常着床和发育，导致有胎心后胎停。另外，母胎免疫耐受异常也可能引发问题，正常情况下母体对胚胎有一定的免疫耐受，但如果这种耐受被打破，母体的免疫系统就会攻击胚胎，导致胎停。例如，一些孕妇存在自然杀伤细胞活性过高等免疫异常情况，会影响胚胎的发育环境，增加有胎心后胎停的风险。
子宫异常：
子宫解剖结构异常：如子宫畸形，像双角子宫、纵隔子宫等，子宫的形态异常会影响胚胎的着床和发育空间。子宫畸形会导致宫腔内环境不利于胚胎生长，增加有胎心后胎停的可能性。
子宫内膜病变：子宫内膜炎、子宫内膜息肉、宫腔粘连等病变都会影响子宫内膜的容受性。子宫内膜容受性是胚胎着床的关键因素，当子宫内膜出现病变时，胚胎难以正常着床和发育，从而容易发生有胎心后胎停。例如，子宫内膜炎会影响子宫内膜的炎症状态，干扰胚胎的着床过程；宫腔粘连会使宫腔有效容积减小，影响胚胎的生长空间。
胎盘因素
胎盘发育异常：胎盘是连接母体和胎儿的重要器官，负责为胎儿提供营养和氧气。如果胎盘发育异常，如胎盘过小、胎盘绒毛膜血管瘤等，会影响胎盘的功能，导致胎儿得不到充足的营养和氧气供应，进而引起有胎心后胎停。胎盘过小会使胎盘的物质交换面积不足，无法满足胎儿生长发育的需求；胎盘绒毛膜血管瘤可能会影响胎盘的血液灌注，干扰胎儿的营养供应。
胎盘早剥：虽然胎盘早剥大多发生在妊娠中晚期，但少数也可能在有胎心后出现胎盘早剥情况。胎盘早剥会导致胎盘与子宫壁之间的血液供应中断，胎儿失去营养和氧气的供应，从而引发胎停。胎盘早剥的发生可能与孕妇外伤、血管病变等多种因素有关，一旦发生，对胎儿的影响非常严重，容易导致有胎心后胎停。
感染因素
TORCH感染：TORCH包括弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。孕妇在孕期感染这些病原体后，病原体可通过胎盘感染胎儿，影响胎儿的正常发育，导致有胎心后胎停。例如，孕妇感染风疹病毒后，胎儿可能会出现先天性白内障、心脏病、耳聋等多种畸形，甚至发生胎停。弓形虫感染可引起胎儿神经系统发育异常等问题，增加胎停的风险。孕妇在孕期应注意避免接触可能导致TORCH感染的危险因素，如避免接触猫粪等可能携带弓形虫的物质，减少感染风险。
