附件囊肿月经时疼痛有生理性和病理性因素。生理性因素包括月经周期中激素变化影响及囊肿位置与月经时盆腔状态；病理性因素涵盖囊肿自身特性（大小、性质及家族遗传等）和炎症相关因素（囊肿合并炎症及相关感染史等）。
一、生理性因素
（一）激素变化影响
1.月经周期中激素波动
在月经周期中，女性体内的雌激素和孕激素会发生周期性变化。对于附件囊肿患者，在月经前期，雌激素水平相对较高，可能会对囊肿产生一定的刺激作用。例如，雌激素可以促进盆腔组织的充血，而附件囊肿所在的区域也可能受到影响，当月经来潮时，这种充血状态可能导致疼痛感觉更加明显。一般来说，正常女性月经周期中激素变化是有规律的，但附件囊肿患者由于囊肿的存在，激素变化对其盆腔组织的影响更为复杂。
孕激素在月经周期后期也会有变化，它对子宫和附件等盆腔组织有一定的作用。附件囊肿患者在月经期间，孕激素水平的波动可能会影响囊肿周围的组织，进而引发疼痛。不同年龄的女性，由于生殖系统的发育和功能状态不同，激素变化对附件囊肿的影响也有所差异。年轻女性生殖系统功能活跃，激素波动相对较大，可能更容易在月经时因激素变化导致附件囊肿相关疼痛；而围绝经期女性激素水平本身处于紊乱状态，附件囊肿合并月经时的疼痛可能更为复杂。
（二）囊肿位置与月经时盆腔状态
1.囊肿位置对疼痛的影响
如果附件囊肿位于卵巢或输卵管等靠近盆腔中央的位置，在月经来潮时，盆腔本身处于充血状态，囊肿可能会因为周围组织的充血而受到挤压或牵拉。例如，卵巢囊肿在月经期间，由于盆腔充血，囊肿与周围组织的关系会发生变化，从而刺激周围的神经末梢，导致疼痛。不同位置的附件囊肿，如卵巢囊肿、输卵管囊肿等，其在月经时受影响的机制略有不同。卵巢囊肿更多与卵巢的血运和组织状态有关，输卵管囊肿则与输卵管的蠕动和充血情况相关。
对于不同生活方式的女性，如长期久坐的女性，盆腔血液循环相对不畅，月经时盆腔充血本身就更明显，附件囊肿患者久坐后月经时附件疼可能会加重。而经常运动的女性盆腔血液循环较好，相对来说月经时附件囊肿相关疼痛可能较轻，但这也不是绝对的，因为囊肿的具体情况不同。有既往盆腔炎病史的女性，附件囊肿合并月经疼的概率可能更高，因为既往盆腔炎可能导致附件周围组织粘连等情况，月经时盆腔充血会进一步加重粘连组织的刺激，从而引发疼痛。
二、病理性因素
（一）囊肿自身特性
1.囊肿的大小与性质
较大的附件囊肿在月经期间更容易引起疼痛。例如，直径大于5cm的卵巢囊肿，在月经时由于盆腔充血，囊肿体积相对增大，对周围组织的压迫和牵拉作用更显著，从而导致疼痛。囊肿的性质也很重要，如巧克力囊肿（子宫内膜异位囊肿），它是子宫内膜异位症的一种表现，在月经期间，异位的子宫内膜会出血，导致囊肿周围炎症反应加重，进而引起明显的附件疼痛。不同性质的囊肿，其在月经时的病理生理过程不同。巧克力囊肿患者的疼痛往往具有进行性加重的特点，年轻女性中患巧克力囊肿的概率相对较高，而绝经后女性相对较少见。
对于有家族遗传倾向附件囊肿的女性，月经时附件疼的风险可能更高。家族中有附件囊肿相关疾病遗传史的女性，其自身患附件囊肿的概率可能增加，而且囊肿的特性可能也与普通人群有所不同，在月经时更容易出现疼痛症状。有附件囊肿病史且复发的女性，在月经时由于囊肿的再次出现或复发，其病理状态与初次发病时可能不同，更容易引发疼痛。
（二）炎症相关因素
1.附件囊肿合并炎症
附件囊肿容易合并炎症，当合并炎症时，在月经期间，炎症反应会加剧。例如，卵巢囊肿合并输卵管炎时，月经来潮时盆腔充血，炎症部位的血管扩张，炎症介质释放增加，刺激周围神经导致疼痛。这种炎症可能是由于病原体感染引起，如沙眼衣原体、淋病奈瑟菌等感染。不同年龄段的女性，附件囊肿合并炎症的病原体感染类型可能有所差异。年轻女性性活跃期，性传播病原体感染导致附件炎症的概率较高；而绝经后女性则可能更多是由于老年阴道炎蔓延等原因引起附件炎症。
有不洁性生活史的女性，附件囊肿合并月经时疼痛的风险增加。不洁性生活史可能导致病原体侵入生殖系统，引发附件的炎症性病变，进而在月经时加重疼痛症状。有宫腔操作史的女性，如人工流产、刮宫等，在月经时附件疼的概率也较高，因为宫腔操作可能导致病原体进入盆腔，引起附件的炎症，而月经时盆腔充血为炎症反应提供了更有利的条件。
