含牙囊肿治疗以手术为主，手术方式有开窗减压术、传统囊肿摘除术。
1.开窗减压术
对于一些巨大的含牙囊肿或者儿童患者，尤其是囊肿累及多个牙胚或者手术风险较高的情况，可以采用开窗减压术。通过在囊肿上开窗，让囊液引流出来，使囊肿缩小，为后续的二期手术创造条件。这种方法可以减小手术的创伤，同时有利于保护颌骨的正常功能和发育。例如，对于儿童患者，由于其颌骨仍在发育阶段，开窗减压术可以避免过早进行大型手术对颌骨发育的影响。
2.传统的囊肿摘除术
适用于囊肿较小、周围骨质破坏相对较轻的患者。手术需要将囊肿完整切除，同时处理受累的牙齿。如果囊肿累及的牙齿牙根吸收不严重，尽量保留牙齿；如果牙齿已经严重受损无法保留，则需要拔除牙齿后再处理囊肿。在手术过程中，要注意保护周围的神经、血管等重要结构。
