脑叶切断术对神经系统可致认知功能损害（如智力下降、注意力不集中、执行功能障碍）、运动功能障碍（如肢体协调性变差、肌肉力量受影响），精神心理方面可致情感淡漠、人格改变，对儿童会严重阻碍其正常生长发育，对老年患者会使原本衰退的身体和大脑功能进一步恶化且恢复差，因具严重不可逆危害已基本被更安全有效治疗方法取代。
神经系统相关危害
认知功能损害：脑叶切断术会对大脑的认知功能产生显著影响。大量研究表明，接受该手术的患者往往会出现不同程度的智力下降，包括记忆力减退，尤其是近期记忆力受损较为明显，患者可能难以记住新接触的信息和日常发生的事情；注意力不集中也是常见表现，难以长时间维持对某一事物的专注；还可能出现执行功能障碍，如计划、组织、解决问题等能力下降，患者在面对需要复杂思维和规划的任务时会显得力不从心。例如，一些长期接受脑叶切断术治疗的患者在术后难以独立完成简单的日常生活事务，如购物、做饭等，因为他们在执行这些任务时的计划和组织能力大幅减弱。
运动功能障碍：部分患者会出现运动功能方面的问题。可能表现为肢体的协调性变差，行走时步态不稳，容易摔倒；肌肉力量也可能受到影响，出现肢体无力的情况，尤其是精细运动功能受损，如无法准确完成用手拿取小物件等动作。这是因为脑叶切断术涉及对大脑相关区域的操作，而这些区域与运动控制的神经通路密切相关，手术可能会破坏或干扰正常的运动神经传导，从而导致运动功能的异常。
精神心理方面危害
情感淡漠：很多接受脑叶切断术的患者会出现情感淡漠的症状。他们对周围的事物缺乏应有的情感反应，对于高兴、悲伤等情绪刺激变得麻木，难以表现出正常的情感表达。例如，面对亲人的离世或重大的喜事，患者的情感反应较为平淡，没有相应强烈的情绪波动，这严重影响了患者的社会交往和生活质量，使他们难以与他人建立正常的情感联系。
人格改变：患者可能会出现明显的人格改变。原本的性格特点可能发生较大转变，变得孤僻、冷漠、缺乏同情心等。一些患者在术后变得对他人漠不关心，行为举止也与术前大不相同，这是由于脑叶切断术影响了大脑中与人格形成和维持相关的区域，导致人格结构发生了不可逆的变化。
对不同人群的特殊影响
儿童患者：儿童处于大脑发育的关键时期，脑叶切断术对儿童患者的危害更为严重。除了上述提到的认知、运动和精神心理方面的损害外，还会严重阻碍儿童的正常生长发育。儿童的大脑正在不断构建各种神经连接和功能区域，脑叶切断术造成的大脑损伤会极大影响其未来的智力发展、人格形成以及社会适应能力的培养。例如，儿童患者术后可能无法正常学习知识，在学校生活中难以与同学和老师进行正常的交流互动，严重影响其整个成长过程。
老年患者：老年患者本身身体机能和大脑功能都处于逐渐衰退的阶段，脑叶切断术对他们的危害会使原本就脆弱的身体和大脑功能进一步恶化。在神经系统方面，可能会加速认知功能的衰退，使老年患者更快地进入痴呆状态；在精神心理方面，情感淡漠和人格改变等问题会让老年患者的生活更加孤独和痛苦，同时也给其家庭照顾带来更大的负担。老年患者术后恢复能力较差，手术带来的各种危害更难通过自身的调节和恢复来缓解。
脑叶切断术由于其对神经系统和精神心理等多方面造成的严重且不可逆的危害，目前已经基本被更安全有效的治疗方法所取代。在医疗实践中，会尽量避免使用这种具有高风险危害的手术方式，而是寻求更科学、对患者损伤更小的治疗手段来解决相关疾病问题。
