盆腔囊肿有生理性和病理性等因素，生理性包括卵泡囊肿及黄体囊肿一般无明显症状可自行消失，病理性有炎症性囊肿（盆腔慢性炎症、结核性盆腔炎）、肿瘤性囊肿（卵巢上皮性肿瘤、卵巢生殖细胞肿瘤、子宫内膜异位囊肿），其他因素有内分泌、生活方式、医源性因素等影响。
一、生理性因素
（一）卵泡囊肿
女性每个月经周期都会有卵泡发育，正常情况下卵泡成熟后会排卵，如果卵泡没有破裂排卵，继续生长就可能形成卵泡囊肿，一般直径多在2-3厘米，通常在月经周期的特定阶段出现，与正常的生殖生理过程相关，多见于育龄期女性，一般无明显症状，多数可自行消失。
（二）黄体囊肿
排卵后卵泡壁塌陷形成黄体，若黄体血肿液化直径大于3厘米则称为黄体囊肿。在孕期也可能出现黄体囊肿，这是因为妊娠后黄体继续发育所致。一般无特殊症状，部分人可能有下腹隐痛等表现，通常可在一段时间后自行消退。
二、病理性因素
（一）炎症性囊肿
1.盆腔慢性炎症：盆腔内的器官如卵巢、输卵管等发生慢性炎症时，炎症刺激可导致组织粘连、包裹，形成囊肿。例如输卵管卵巢炎，长期的炎症会使输卵管伞端粘连闭锁，浆液性渗出物积聚形成输卵管积水，进而与卵巢粘连形成炎性囊肿。这种情况在有盆腔炎症病史的女性中较为常见，尤其是性生活活跃的育龄女性，可能伴有下腹坠胀、疼痛、白带增多等症状。
2.结核性盆腔炎：由结核分枝杆菌感染引起，结核病变可累及盆腔内的组织和器官，如输卵管、卵巢等，形成结核性囊肿。患者可能有低热、盗汗、乏力等全身症状，同时伴有盆腔疼痛、月经异常等表现，多见于有结核病史或接触过结核患者的人群。
（二）肿瘤性囊肿
1.卵巢上皮性肿瘤
浆液性肿瘤：分为浆液性囊腺瘤、交界性浆液性肿瘤和浆液性囊腺癌。浆液性囊腺瘤是最常见的卵巢良性肿瘤，多为单侧，球形，大小不等，表面光滑；交界性浆液性肿瘤具有一定的恶性潜能；浆液性囊腺癌是卵巢恶性肿瘤中最常见的类型，生长迅速，多为双侧，囊实性，囊内有乳头生长。发病原因可能与遗传因素、内分泌因素等有关，有家族卵巢肿瘤病史的人群发病风险相对较高，多见于中老年女性。
黏液性肿瘤：黏液性囊腺瘤是较常见的良性肿瘤，多为单侧，体积较大或巨大，表面光滑，切面为多房，囊内充满胶冻样黏液；黏液性囊腺癌较少见，预后相对较差。其发病也可能与遗传等因素相关，同样可见于育龄及中老年女性。
2.卵巢生殖细胞肿瘤
成熟畸胎瘤：又称皮样囊肿，是最常见的卵巢良性肿瘤，可发生于任何年龄，以20-40岁居多。肿瘤多为单侧，中等大小，呈圆形或椭圆形，表面光滑，壁薄质韧。其由多胚层组织构成，内含有油脂、毛发、牙齿等多种成分，发病原因尚不明确，可能与生殖细胞异常分化等有关。
未成熟畸胎瘤：属于恶性肿瘤，多见于青少年及年轻女性，肿瘤多为单侧，较大，呈实体性，可有囊性区域，切面多为实性，质脆，其中含未成熟的胚胎组织。
（三）子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
子宫内膜组织出现在盆腔内其他部位，如卵巢，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊肿内含暗褐色、似巧克力样糊状陈旧血性液体。多见于育龄期女性，与子宫内膜异位症的发病机制相关，可能与经血逆流、遗传、免疫等因素有关，患者多有进行性加重的痛经、不孕等表现，且症状会随月经周期而变化。
三、其他因素
（一）内分泌因素
长期的内分泌失调可能影响盆腔内器官的正常功能，从而诱发囊肿。例如雌激素水平过高可能刺激卵巢等器官过度增生，增加囊肿形成的风险。在一些患有内分泌疾病如多囊卵巢综合征的女性中，就容易出现卵泡发育异常、黄体功能不全等情况，进而导致囊肿发生，这类患者常伴有月经紊乱、多毛、肥胖等症状。
（二）生活方式因素
长期的不良生活方式也可能对盆腔囊肿的形成产生影响。例如长期熬夜、过度劳累会影响身体的内分泌调节和免疫系统功能；长期精神压力过大可能导致神经内分泌失调，这些都可能增加盆腔囊肿的发病几率。另外，吸烟、酗酒等不良生活习惯也可能对盆腔器官的健康产生不利影响，从而增加囊肿发生的可能性。
（三）医源性因素
如腹部手术史，术后盆腔组织粘连等可能导致囊肿形成。另外，宫内节育器的使用与盆腔囊肿的关系目前存在一定争议，但有研究认为部分女性在放置宫内节育器后可能出现盆腔炎症等情况，进而增加囊肿形成的风险，不过这种情况相对较少见。
