扁平疣治疗方法有药物治疗、物理治疗、免疫调节治疗等。
1.药物治疗
可遵医嘱选用维A酸类药物，如维A酸乳膏等，其通过调节表皮细胞分化，抑制角质形成细胞的增殖，从而发挥治疗扁平疣的作用；此外，还可使用具有抗病毒作用的外用制剂，如干扰素等，通过干扰病毒核酸合成及蛋白代谢来抑制病毒复制。
对于病情较为顽固或反复发作的患者，可考虑使用免疫调节剂，如转移因子等，通过调节机体免疫功能，增强机体对病毒的清除能力，但需在医生指导下使用，注意药物可能带来的免疫相关不良反应。
2.物理治疗
冷冻治疗利用低温（通常为液氮）使疣体组织坏死、脱落。该方法操作相对简便，但可能会引起局部疼痛、水疱等反应，治疗后需注意保持局部清洁，避免感染。
激光治疗通过高能量激光烧灼疣体，使其去除。适用于较小且数量不多的疣体，治疗后局部可能会有短暂红肿，需注意防晒及创面护理。
电灼治疗借助高频电流烧灼疣体，对于较厚的疣体有较好的去除效果，治疗后需关注创面恢复情况，防止感染。
3.免疫调节治疗
对于反复发作或经其他治疗效果不佳的扁平疣患者，可考虑使用免疫调节剂来增强机体免疫力，帮助清除病毒，如环孢素、硫唑嘌呤等。但此类治疗需在专业医生评估后进行，根据患者具体情况选择合适的免疫调节方案。
