支原体感染分呼吸道和泌尿生殖系统感染，儿童呼吸道感染潜伏期一般为2-3周起病缓初期有全身不适等表现后发热咳嗽婴幼儿症状重，成人发热程度不一咳嗽明显有全身症状，男性泌尿生殖系统感染多为非淋菌性尿道炎起病缓有尿道刺痒等症状，女性宫颈是常见感染部位有症状者阴道分泌物多等；衣原体感染分沙眼衣原体和肺炎衣原体感染，沙眼衣原体眼部感染多见于儿童青少年急性期有畏光流泪等表现慢性期有并发症，泌尿生殖系统感染女性宫颈感染症状与支原体类似可致盆腔炎等，男性引起非淋菌性尿道炎症状与支原体感染相似，肺炎衣原体呼吸道感染多见于儿童青少年起病隐匿早期有上呼吸道感染表现后咳嗽伴发热等全身症状。
一、支原体感染的症状
（一）呼吸道支原体感染
1.儿童：
潜伏期一般为2-3周。起病较缓慢，初期可有全身不适、乏力等表现，之后逐渐出现发热，体温可高达39℃左右，可持续1-3周。咳嗽是较为突出的症状，多为刺激性干咳，有时可伴有少量黏痰，年长儿可诉胸痛等。婴幼儿症状相对较重，可出现喘息、气促等表现，部分患儿可能会发展为支原体肺炎，严重时可影响呼吸功能，出现呼吸困难等情况，这与儿童呼吸道解剖结构和免疫系统发育尚未完善有关，其呼吸道黏膜较脆弱，感染后炎症反应相对更易波及周围组织。
2.成人：
发热程度不一，可为低热或高热，发热持续时间个体差异较大。咳嗽同样明显，以干咳为主，可伴有咽喉疼痛、头痛等症状，部分患者还可能出现乏力、食欲不振等全身症状，一般病程相对儿童可能稍长一些，但具体也因个体免疫状态等因素不同而有差异。
（二）泌尿生殖系统支原体感染
1.男性：
非淋菌性尿道炎是常见表现，潜伏期一般为1-3周。起病较缓慢，主要症状有尿道刺痒、烧灼感，伴有不同程度的尿频、尿急，尿道口可轻度红肿，有少量稀薄的浆液性分泌物，晨起时可能会有“糊口”现象。部分患者可无明显症状，成为携带者，在性传播中起到重要作用，这与男性泌尿生殖系统的生理结构特点有关，尿道相对较长且较细，感染后炎症反应相对隐匿。
2.女性：
宫颈是最常见的感染部位，多数患者无明显症状，有症状者主要表现为阴道分泌物增多，呈黏液脓性，外阴瘙痒或灼热感，可伴有尿道炎症状，如尿频、尿急等，也可引起盆腔炎等并发症，出现下腹部疼痛、性交痛等，若不及时治疗，可能会影响生育等，因为女性生殖系统相对复杂，感染后炎症容易蔓延至盆腔等部位，且女性的生理周期等因素也可能影响感染后的症状表现。
二、衣原体感染的症状
（一）沙眼衣原体感染
1.眼部感染：
沙眼是常见的眼部感染类型，多见于儿童及青少年，潜伏期5-12天。急性期表现为畏光、流泪、异物感，伴有较多黏液或脓性分泌物，结膜充血明显，乳头增生，滤泡形成等。慢性期可出现眼睑内翻、倒睫、角膜混浊等并发症，严重影响视力，儿童由于卫生习惯相对较差，且眼部组织娇嫩，容易通过接触被污染的物品等途径感染沙眼衣原体，比如共用毛巾等。
2.泌尿生殖系统感染：
女性：
宫颈感染较为常见，症状与支原体感染类似，可出现阴道分泌物增多，呈黏液脓性，宫颈充血、水肿等，也可引起盆腔炎等，出现下腹部疼痛、月经紊乱等，对生育可能产生影响，如导致输卵管粘连、阻塞等，影响受精卵的运输，进而影响怀孕。
男性：
引起非淋菌性尿道炎，症状与支原体感染导致的非淋菌性尿道炎相似，有尿道刺痒、烧灼感、尿频、尿急等，尿道口轻度红肿，分泌物稀薄等，但相对支原体感染，症状可能在表现程度上略有不同，具体也因个体差异而异。
（二）肺炎衣原体感染
1.呼吸道感染：
多见于儿童和青少年，起病隐匿，潜伏期约10-65天。早期症状较轻，可有上呼吸道感染表现，如咽痛、声音嘶哑等，之后逐渐出现咳嗽，多为干咳或少量黏痰，可伴有发热，体温一般为低热或中度发热，部分患者可出现头痛、乏力等全身症状，儿童的免疫系统相对较弱，感染后呼吸道的炎症反应可能导致咳嗽等症状持续时间相对较长，影响儿童的日常生活和休息。
