男性阴茎根部疼痛可由多种因素引起，外伤因素包括外力撞击和性生活损伤；感染因素有尿道炎蔓延、前列腺炎放射痛、阴茎根部皮肤感染；结石因素包含尿道结石及膀胱或输尿管下段结石放射痛；肿瘤因素涉及阴茎根部肿瘤和前列腺肿瘤；其他因素有精索静脉曲张和心理因素等。
一、外伤因素
（一）外力撞击
男性阴茎根部受到外力撞击，如性生活中姿势不当、运动时会阴部受到碰撞等，可能导致局部软组织损伤甚至阴茎海绵体白膜破裂等情况，从而引起疼痛。不同年龄段人群都可能发生，年轻人性生活活跃或运动爱好者更易因运动相关撞击受伤。例如，进行篮球等激烈运动时，会阴部防护不当就容易发生阴茎根部撞击伤。
（二）性生活损伤
性生活过程中过于粗暴，可能造成阴茎根部的摩擦损伤或系带撕裂等，进而引发疼痛。尤其对于性生活经验不足的人群，更容易因动作不当出现此类情况。比如性生活时用力过猛、姿势突然改变等都可能导致阴茎根部损伤。
二、感染因素
（一）尿道炎蔓延
尿道发生感染时，如淋菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎等，炎症可能蔓延至阴茎根部周围组织，引起局部炎症反应，出现疼痛症状。各年龄段均可发病，有不洁性生活史的人群感染风险较高。例如，不洁性行为后感染淋病奈瑟菌，就可能引发尿道炎并蔓延导致阴茎根部疼痛。
（二）前列腺炎放射痛
前列腺位于阴茎根部附近，当前列腺发生炎症时，炎症刺激可能通过神经反射引起阴茎根部放射性疼痛。中年男性相对更易患前列腺炎，长期久坐、酗酒、性生活不规律等是前列腺炎的常见诱因。如长期久坐的办公室职员，由于会阴部血液循环不畅，容易引发前列腺炎，进而可能出现阴茎根部放射痛。
（三）阴茎根部皮肤感染
阴茎根部皮肤发生感染，如毛囊炎、皮脂腺囊肿感染等，局部会出现红肿、疼痛等症状。任何年龄段都可能发生，不注意阴茎根部卫生的人群更易出现皮肤感染。比如平时不经常清洗阴茎根部，导致污垢堆积，容易引发皮肤感染。
三、结石因素
（一）尿道结石
尿道内的结石可能停留于阴茎根部附近的尿道部位，刺激尿道黏膜，引起疼痛，同时可能伴有排尿困难等症状。各年龄段均有发病可能，有尿道狭窄、感染等病史的人群更容易形成尿道结石。例如，既往有尿道感染病史的患者，尿液中的某些成分容易沉积形成结石。
四、泌尿系统结石放射痛
（一）膀胱结石或输尿管下段结石
膀胱结石或输尿管下段结石，疼痛可放射至阴茎根部。不同年龄人群都可能患泌尿系统结石，长期饮水少、饮食中高钙高草酸等成分摄入过多等是常见诱因。比如长期喝很少量的水，尿液浓缩，容易形成结石，结石移动时可能放射至阴茎根部引起疼痛。
五、肿瘤因素
（一）阴茎根部肿瘤
阴茎根部的肿瘤，如阴茎癌早期可能表现为阴茎根部的硬结、疼痛等症状，随着病情进展症状会逐渐加重。多见于中老年男性，有包皮过长或包茎且不注意清洁的人群发病风险相对较高。例如，包皮过长者若不经常清洗，容易引发阴茎局部病变，增加阴茎癌的发病几率。
（二）前列腺肿瘤
前列腺肿瘤也可能引起阴茎根部的牵涉痛等表现，多见于中老年男性，随着年龄增长发病风险逐渐增加。定期进行前列腺相关检查有助于早期发现前列腺肿瘤。
六、其他因素
（一）精索静脉曲张
精索静脉曲张时，可能会引起阴囊内温度升高、血液淤滞等，进而可能导致阴茎根部附近出现坠胀、隐痛等不适。中青年男性较多见，长时间站立等可加重症状。比如长期从事站立工作的人群，精索静脉曲张的发生率相对较高。
（二）心理因素
长期精神紧张、焦虑等心理因素也可能导致阴茎根部出现牵涉性疼痛，尤其在一些有焦虑倾向的人群中较常见。心理因素引起的疼痛可能没有明显的器质性病变基础，但会对生活质量产生影响。
