阴茎软时很小的原因包括生理性因素如正常生理差异和年龄因素影响、病理性因素如内分泌疾病（睾酮缺乏、垂体疾病）、染色体异常（克氏综合征）、阴茎发育异常，以及生活方式因素如肥胖、不良生活习惯（吸烟、酗酒），若发现阴茎软时小且有其他异常表现应及时就医做全面检查明确原因并治疗。
一、生理性因素
（一）正常生理差异
成年男性阴茎在疲软状态下长度存在个体差异，一般来说，疲软状态下长度在3-5厘米左右都可能是正常的生理现象，这主要与遗传因素有关，不同个体的基因决定了阴茎发育的基础状态，存在一定的正常变异范围。例如，相关流行病学调查显示，大部分男性疲软状态下阴茎长度处于这个区间范围，只要不影响正常的性功能和生育等功能，就属于正常情况。
（二）年龄因素影响
在青春期前，阴茎处于发育的初始阶段，疲软状态下长度较短是正常的，因为此时生殖系统尚未完全发育成熟。随着青春期的到来，阴茎会逐渐发育增长，但不同个体进入青春期的时间和发育速度不同，所以在青春期前及青春期早期，疲软状态下阴茎较小可能是正常的生理发育进程中的表现。
二、病理性因素
（一）内分泌疾病
1.睾酮缺乏：睾酮是维持男性生殖系统发育和功能的重要激素。如果体内睾酮分泌不足，会影响阴茎的正常发育和维持。例如，先天性睾丸发育不全综合征患者，由于睾丸功能异常，睾酮分泌减少，会导致阴茎在疲软状态下较小，同时可能伴有第二性征不明显等表现。相关研究表明，这类患者体内睾酮水平明显低于正常男性，通过激素检测可以明确诊断。
2.垂体疾病：垂体是调节内分泌的重要器官，垂体瘤等垂体疾病可能会影响促性腺激素的分泌，进而影响睾酮的产生，导致阴茎发育异常，出现疲软状态下较小的情况。例如，垂体瘤患者可能会因为促性腺激素分泌障碍，引起生殖系统发育不良，包括阴茎疲软状态下长度较小。
（二）染色体异常
1.克氏综合征：这是一种常见的性染色体异常疾病，患者染色体核型为47，XXY。此类患者由于染色体异常，会出现睾丸发育不良，睾酮分泌减少，导致阴茎在疲软状态下较小，同时伴有睾丸小、乳房发育等表现。通过染色体核型分析可以明确诊断，这类患者的生殖功能往往也会受到影响。
（三）阴茎发育异常
1.先天性小阴茎：是指阴茎在胚胎发育过程中出现异常，导致出生后阴茎疲软状态下较小。其病因可能与胚胎期雄激素分泌不足或作用异常等有关。患者除了阴茎疲软状态下短小外，还可能伴有其他泌尿生殖系统的畸形等情况。
三、生活方式因素
（一）肥胖
肥胖男性可能会因为腹部脂肪堆积，导致阴茎被脂肪组织包裹，从外观上看疲软状态下阴茎显得较小。研究发现，肥胖会影响体内激素代谢，例如可能导致雌激素水平相对升高，雄激素水平相对降低，进而影响阴茎的发育和状态。同时，肥胖还可能引起血管内皮功能异常等，影响阴茎的血液供应等，对阴茎的正常状态产生不利影响。
（二）不良生活习惯
1.吸烟：吸烟产生的尼古丁等有害物质会影响血管内皮功能，导致阴茎海绵体血管收缩，影响阴茎的血液灌注。长期吸烟的男性，可能会出现阴茎疲软状态下异常，包括长度较小等情况。相关研究表明，吸烟男性阴茎海绵体血管内皮细胞功能受损的比例明显高于非吸烟男性。
2.酗酒：长期大量酗酒会影响肝脏功能，进而影响激素的代谢和灭活。酒精还可能直接损害生殖系统的细胞，影响阴茎的正常发育和维持。酗酒男性可能会出现内分泌紊乱，影响睾酮水平等，从而导致阴茎疲软状态下较小。
如果发现阴茎软的时候很小且伴有其他异常表现，如第二性征不明显、性功能障碍等情况，应及时就医，进行全面的检查，包括激素水平检测、染色体检查、阴茎超声等相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。
