阴茎短小受遗传因素内分泌因素肥胖因素疾病因素生活方式因素影响遗传因素使家族男性普遍短小者个体易现此情况内分泌中雄激素等水平异常会致发育受影响肥胖致腹部脂肪多使阴茎显短尿道下裂等先天畸形睾丸疾病染色体异常等疾病会引发阴茎短小不良饮食习惯吸烟酗酒缺乏运动等生活方式也有影响特殊人群需重视及时就医检查。
阴茎的大小受遗传基因的控制与影响。如果家族中的男性普遍存在阴茎短小的情况，那么个体出现阴茎短小的可能性会相对较高。这是因为基因决定了身体的生长发育模式，包括生殖器官的发育情况，相关研究表明，遗传因素对阴茎长度的影响大约占30%-40%左右。
内分泌因素
雄激素水平：雄激素是影响男性生殖器官发育的重要激素。在胎儿时期，雄激素水平正常与否会影响阴茎的分化与发育；在青春期，雄激素水平不足会导致阴茎发育迟缓、短小。例如，先天性肾上腺皮质增生症等疾病可能会导致雄激素合成障碍，从而引起阴茎短小。正常男性体内雄激素主要由睾丸分泌，当睾丸功能异常时，如睾丸炎、隐睾等疾病，会影响雄激素的分泌，进而影响阴茎的发育。一般来说，血清睾酮水平低于正常范围且伴有阴茎短小的情况较为常见。
其他内分泌激素：除雄激素外，生长激素、促性腺激素等也与阴茎发育有关。生长激素能促进身体的生长发育，包括生殖器官的生长；促性腺激素则直接作用于睾丸，调节雄激素的分泌和生殖细胞的发育。如果这些激素分泌异常，也可能导致阴茎短小。
肥胖因素
肥胖男性中，部分人会出现阴茎短小的情况。这是因为肥胖者腹部脂肪堆积较多，会导致耻骨前脂肪垫增厚，使得阴茎根部埋藏在脂肪组织中，从外观上看阴茎显得短小。有研究发现，肥胖男性的阴茎长度平均比正常体重男性短约1-2厘米左右。而且肥胖还可能通过影响内分泌系统，进一步干扰雄激素的代谢等，从而间接影响阴茎的发育。
疾病因素
尿道下裂等先天性尿道畸形：尿道下裂是一种常见的先天性尿道畸形，除了尿道开口异常外，往往还伴有阴茎短小、弯曲等情况。这是由于胚胎发育过程中尿道沟融合不全等原因导致，会影响阴茎的正常形态和发育。
睾丸疾病：如睾丸发育不良、无睾症等。睾丸是产生雄激素和生成精子的重要器官，睾丸发育不良会使雄激素分泌减少，影响阴茎的发育，导致阴茎短小；无睾症患者由于没有睾丸，体内几乎没有雄激素分泌，阴茎会明显短小，且第二性征也不明显。
染色体异常：例如克氏综合征，患者的染色体核型为47，XXY，这类患者睾丸发育不全，雄激素分泌不足，除了阴茎短小外，还可能伴有乳房发育等女性化表现。
生活方式因素
不良饮食习惯：长期营养不良，尤其是缺乏蛋白质、维生素等营养物质，会影响身体的正常生长发育，包括生殖器官的发育。例如，长期素食且营养不均衡的男性，可能会出现阴茎发育不良的情况。
吸烟酗酒：吸烟会导致血管收缩，影响阴茎的血液供应，长期吸烟可能会影响阴茎海绵体的发育和功能；酗酒会损害肝脏等器官，影响激素的代谢和正常生理功能，进而影响阴茎的发育。有研究显示，吸烟酗酒的男性发生阴茎短小的概率比不吸烟不酗酒的男性高约20%左右。
缺乏运动：缺乏运动的男性身体代谢水平相对较低，可能会影响内分泌系统的正常功能，也不利于身体的正常生长发育，从而可能对阴茎的发育产生一定的不利影响。
对于特殊人群，比如儿童时期如果发现阴茎短小，家长应引起重视，及时带孩子就医检查，排除先天性疾病等因素；青春期男性如果发现阴茎短小，要注意观察是否有内分泌异常等情况，同时保持健康的生活方式，如合理饮食、适量运动等；成年男性如果发现阴茎短小且伴有其他不适症状，如性功能障碍等，应及时到正规医院就诊，进行全面的检查，明确原因后采取相应的措施。
