扁桃体发炎可由病原体感染引起，细菌如A族乙型溶血性链球菌、葡萄球菌可致炎，病毒如腺病毒、鼻病毒、EB病毒也能引发；儿童因免疫系统未完全发育成熟易发病，成年人免疫力低下时也易遭感染；气候骤变、空气污染、生活环境不良等环境因素会增加发病几率；邻近器官炎症蔓延及口腔卫生不良也可导致扁桃体发炎。
一、病原体感染
（一）细菌感染
1.A族乙型溶血性链球菌：是引发扁桃体发炎最常见的细菌病原体。这种细菌常存在于人的咽部及扁桃体隐窝内，当人体抵抗力下降时，如儿童因年龄小免疫系统发育尚不完善、过度疲劳、营养不良等情况，该细菌就会大量繁殖，侵袭扁桃体，导致扁桃体发炎，引发咽痛、发热等症状，相关研究表明约50%的扁桃体炎由A族乙型溶血性链球菌感染引起。
2.葡萄球菌：也是可能导致扁桃体发炎的细菌之一，可通过空气飞沫、接触等途径传播，在机体抵抗力降低时容易侵入扁桃体引发炎症，其引发的扁桃体炎症状表现多样，轻重程度不一。
（二）病毒感染
1.腺病毒：是常见的引起扁桃体发炎的病毒之一，可导致上呼吸道感染相关的扁桃体炎症，在儿童群体中较为常见，腺病毒感染引起的扁桃体炎往往具有一定的传染性，可通过密切接触等方式传播，感染后可出现扁桃体红肿、疼痛等症状。
2.鼻病毒：可引起普通感冒等上呼吸道疾病，当累及扁桃体时也会导致扁桃体发炎，其感染多见于季节交替时，人群普遍易感，感染后扁桃体可能出现不同程度的炎症反应，如红肿等。
3.EB病毒：EB病毒感染可引起传染性单核细胞增多症，其中扁桃体发炎是常见的临床表现之一，患者除了有扁桃体红肿外，还可能伴有发热、淋巴结肿大等其他表现，在青少年等人群中相对多见。
二、免疫力因素
（一）儿童群体
儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，抵抗力相对较弱，相比成年人更容易受到病原体的侵袭而引发扁桃体发炎。例如3-10岁的儿童，扁桃体处于相对活跃的阶段，接触病原体的机会较多，当身体疲劳、营养不良或者环境因素变化时，很容易出现扁桃体发炎的情况。
（二）成年人免疫力低下情况
成年人如果长期处于疲劳状态、过度吸烟饮酒、患有慢性疾病（如糖尿病等）导致身体免疫力下降时，也容易遭受病原体感染而引发扁桃体发炎。比如长期吸烟的人，烟草中的有害物质会损害呼吸道黏膜，包括扁桃体的黏膜，使扁桃体的防御能力降低，增加感染病原体引发炎症的风险。
三、环境因素
（一）气候因素
季节变化时气温骤变，如果没有及时增减衣物，人体容易受凉，导致呼吸道局部抵抗力下降，从而增加扁桃体发炎的几率。例如在秋冬季节，气温较低，若不注意保暖，上呼吸道容易受到寒冷空气的刺激，使得扁桃体的血管收缩，血液循环不畅，局部抵抗力降低，病原体容易入侵引发炎症。
（二）空气污染
长期处于空气污染较为严重的环境中，如空气中存在大量的粉尘、有害气体（二氧化硫、二氧化氮等），这些污染物会刺激扁桃体黏膜，损伤其防御功能，使扁桃体容易受到病原体的感染而发炎。例如在工业污染较为严重的地区，居民患扁桃体炎的几率可能相对较高。
（三）不良生活环境
生活环境拥挤、通风不良等情况也有利于病原体的传播，增加扁桃体发炎的可能性。比如在学校宿舍、集体生活场所等，如果居住环境拥挤且通风不好，当有同学患扁桃体炎时，病原体容易在空气中传播，导致其他人更容易感染而引发扁桃体发炎。
四、其他因素
（一）邻近器官炎症蔓延
如鼻腔、鼻窦的炎症可蔓延至扁桃体，引发扁桃体发炎。例如鼻窦炎时，鼻腔内的炎症分泌物可能通过后鼻孔流入咽部，长期刺激扁桃体，导致扁桃体炎症反复发作。
（二）口腔卫生不良
口腔内存在大量的细菌等微生物，若不注意口腔卫生，食物残渣残留、牙菌斑堆积等，容易滋生细菌，这些细菌可能会蔓延至扁桃体，引起扁桃体发炎。尤其是儿童如果没有养成良好的刷牙习惯，口腔卫生状况较差，更容易出现扁桃体发炎的情况。
