早上嗓子疼可能由感染因素（病毒如普通感冒病毒、流感病毒，细菌如链球菌感染）、环境因素（空气干燥、空气污染）、用嗓过度（日常用嗓、睡眠时张口呼吸）、过敏因素（季节性过敏、室内过敏原）引起。
一、感染因素
（一）病毒感染
1.常见病毒及影响
普通感冒病毒是导致早上嗓子疼常见的原因之一。例如，鼻病毒感染较为常见，病毒侵袭上呼吸道，引发咽部炎症反应，导致嗓子疼痛。研究表明，在普通感冒患者中，约有相当比例会出现晨起嗓子疼的症状，这是因为夜间睡眠时，呼吸道分泌物积聚在咽部，炎症刺激在晨起时更为明显。不同年龄段人群都可能受到影响，儿童由于免疫系统发育尚未完善，相对更容易因病毒感染出现嗓子疼情况，且症状可能相对更明显些；成年人也会因接触病毒而发病。
流感病毒感染也可引起早上嗓子疼，流感病毒感染后，除了有发热、咳嗽等典型症状外，咽部炎症是常见表现，晨起时由于经过一夜的休息，身体代谢相对缓慢，炎症因子积聚，嗓子疼会较为突出。
（二）细菌感染
链球菌感染是常见的细菌感染导致嗓子疼的原因。A组β溶血性链球菌感染引起的急性扁桃体炎等疾病，会出现明显的咽部疼痛，早上起来时由于睡眠中咽部活动减少，炎症刺激传导更清晰，嗓子疼感觉较明显。在学龄儿童中，链球菌感染导致的嗓子疼较为常见，需要及时关注，因为若不及时治疗可能引发风湿热等并发症。成年人也可能因免疫力下降等因素感染链球菌而出现晨起嗓子疼。
二、环境因素
（一）空气干燥
室内空气过于干燥时，夜间睡眠过程中，呼吸道黏膜水分流失过多，咽部黏膜干燥，晨起时就会出现嗓子疼的情况。尤其是在秋冬季节，使用暖气、空调等设备时，空气湿度容易降低，如果不注意增加空气湿度，就更容易出现这种情况。不同年龄人群都可能受影响，儿童的呼吸道黏膜相对娇嫩，对空气干燥更为敏感；老年人本身呼吸道功能有所减退，也容易因空气干燥出现嗓子疼。
（二）空气污染
空气中存在大量污染物，如雾霾中的颗粒物、有害气体等，夜间睡眠时，咽部持续接触这些污染物，会刺激咽部黏膜，导致晨起嗓子疼。长期处于空气污染严重环境中的人群，患病风险更高。例如长期生活在工业城市、雾霾频发地区的人群，早上嗓子疼的发生率相对较高。不同年龄段人群都会受到影响，儿童的呼吸系统更易受外界污染物影响，老年人的呼吸道防御功能相对较弱，也容易受到空气污染的侵害。
三、用嗓过度
（一）日常用嗓情况
前一天过度用嗓，比如长时间讲话、大声唱歌等，会导致咽部肌肉疲劳，黏膜受损，晨起时就会出现嗓子疼。对于教师、歌手等职业用嗓人群，这种情况更为常见。不同年龄的用嗓职业人群都可能出现，儿童如果有过度喊叫等用嗓过度情况也会出现嗓子疼，比如在玩耍时长时间大声叫嚷后，晨起可能嗓子疼。
（二）睡眠时的用嗓情况
有些人睡眠时习惯张口呼吸，尤其是在鼻部通气不畅时，张口呼吸会使咽部直接暴露在干燥的空气中，且气流快速通过咽部，导致咽部黏膜干燥、受损，晨起时嗓子疼。例如患有鼻炎、鼻窦炎等疾病导致鼻部通气受阻的人群，更容易出现这种情况。不同年龄段人群都可能发生，儿童若有腺样体肥大等情况导致鼻部通气不畅，睡眠时张口呼吸，晨起嗓子疼的几率增加；成年人也可能因鼻部疾病出现睡眠时张口呼吸进而晨起嗓子疼。
四、过敏因素
（一）季节性过敏
在花粉传播的季节，如春季，空气中花粉含量较高，过敏体质的人接触花粉后，会引起咽部的过敏反应，导致嗓子疼，晨起时可能更为明显。不同年龄的过敏体质人群都可能受到影响，儿童如果是过敏体质，在花粉季节也容易出现晨起嗓子疼，且可能伴有流涕、打喷嚏等症状；成年人过敏体质者也会因接触花粉出现相应症状。
（二）室内过敏原
室内的过敏原，如尘螨、宠物毛发皮屑等，也可能引起咽部过敏反应。夜间睡眠时，人体与室内过敏原接触，晨起时出现嗓子疼。有宠物饲养的家庭，宠物毛发皮屑容易积聚在室内，过敏体质的人更容易发病。不同年龄段人群中，过敏体质者都可能因室内过敏原出现晨起嗓子疼，儿童如果对宠物毛发皮屑过敏，症状可能更易被察觉，如出现嗓子疼、咳嗽等表现。
