扁桃体结石由食物残渣、细菌、死细胞、黏液等在扁桃体隐窝内沉积钙化形成，其形成与食物残渣残留（受年龄、性别、生活方式、病史影响）、细菌感染（受年龄、性别、生活方式、病史影响）、黏液分泌与排出障碍（受年龄、性别、生活方式、病史影响）相关。
1.食物残渣残留因素
年龄方面：儿童和青少年相对来说更容易发生扁桃体结石吗？其实年龄不是绝对因素，但儿童的口腔卫生习惯如果不佳，比如进食后没有及时清洁口腔，食物残渣更容易在扁桃体隐窝内残留。例如，儿童在食用一些黏性较大的食物，如糖果、年糕等后，如果没有好好漱口，食物残渣就容易滞留在扁桃体隐窝中。对于成年人，若有不良的饮食习惯，如经常吃一些辛辣、油腻且不易清洁口腔的食物，也会增加食物残渣在扁桃体隐窝残留的概率。
性别方面：目前没有明确的性别差异导致扁桃体结石中食物残渣残留方面的显著不同。不过，不同性别的人在口腔卫生维护的行为习惯上可能存在差异，比如女性可能相对更注重口腔清洁，但这也不是绝对的，不能单纯从性别角度判断食物残渣残留与扁桃体结石形成的关系。
生活方式方面：长期吸烟的人，烟草中的有害物质会刺激扁桃体隐窝的黏膜，影响分泌物的正常排出，同时吸烟过程中也会有一些残留物质附着在扁桃体隐窝内，增加结石形成风险。而长期酗酒的人，酒精会对口腔和扁桃体局部的环境产生不良影响，干扰正常的生理代谢，使得食物残渣等更易积聚。
病史因素：如果既往有扁桃体炎病史，扁桃体反复发炎会导致隐窝口变得狭窄，分泌物更难排出，从而为食物残渣等物质的积聚创造更有利的条件，进而增加扁桃体结石形成的可能性。例如，曾多次患扁桃体炎的患者，其扁桃体隐窝长期处于炎症状态，隐窝结构已经受到一定破坏，更容易发生结石。
2.细菌感染因素
年龄方面：儿童免疫系统相对不完善，更容易受到细菌感染。比如儿童在感冒等上呼吸道感染后，细菌容易在扁桃体隐窝内滋生繁殖，参与结石的形成过程。而老年人由于免疫系统功能衰退，也较容易发生细菌在扁桃体隐窝的感染，从而增加结石形成几率。
性别方面：同样没有明显的性别差异导致细菌感染在扁桃体结石形成中的特殊影响。但不同性别的人在接触细菌的环境和频率上可能有不同，比如男性如果从事一些接触较多细菌的职业，如厨师等，相对可能接触细菌的机会更多，增加扁桃体隐窝细菌感染的风险。
生活方式方面：经常在不卫生环境中活动的人，如长时间处于人员密集且卫生条件差的场所，更容易接触到各种细菌，增加扁桃体隐窝细菌感染的可能。例如，经常在拥挤的公共交通工具上的人群，感染细菌的几率相对较高，进而影响扁桃体隐窝的正常生理状态，促进结石形成。
病史因素：有慢性呼吸道疾病病史的人，如慢性支气管炎患者，其呼吸道的细菌环境可能会影响到扁桃体部位，使得扁桃体隐窝更容易受到细菌感染，从而与扁桃体结石形成相关。比如慢性支气管炎患者长期存在呼吸道细菌感染，炎症状态可能蔓延至扁桃体，导致结石形成相关因素增多。
3.黏液分泌与排出障碍因素
年龄方面：幼儿时期，扁桃体的生理功能还在发育中，黏液分泌和排出的调节机制不够完善，相对容易出现黏液排出不畅的情况。随着年龄增长，到了中老年时期，身体各项机能包括扁桃体的分泌功能都会逐渐衰退，也会影响黏液的正常分泌与排出，从而增加扁桃体结石形成风险。
性别方面：没有因性别导致黏液分泌与排出障碍的特异性差异。但女性在生理期等特殊时期，身体激素水平会发生变化，可能会对扁桃体的黏液分泌有一定影响，但这种影响相对较小，不是导致结石形成的主要性别相关因素。
生活方式方面：长期处于干燥环境中的人，如生活在气候干燥地区或者长时间待在空调房间且不注意补充水分的人，口腔和扁桃体局部黏膜会比较干燥，黏液的流动性变差，更容易导致黏液在扁桃体隐窝内潴留，进而促进结石形成。
病史因素：患有干燥综合征等自身免疫性疾病的人，会影响全身的黏液分泌功能，扁桃体部位的黏液分泌也会受到波及，导致排出障碍，大大增加扁桃体结石形成的可能性。例如干燥综合征患者，其唾液腺等黏液分泌腺体功能受损，扁桃体的黏液分泌也异常，容易引发结石。
