空囊不自己流产的原因包括胚胎因素（染色体异常）、母体因素（内分泌因素如黄体功能不全、甲状腺功能异常，免疫因素如自身免疫性疾病、同种免疫异常）、子宫因素（子宫解剖结构异常如子宫畸形、子宫肌瘤）、环境因素（化学物质接触、辐射暴露）。
染色体异常：这是导致空囊的常见原因之一。在胚胎发育过程中，如果染色体出现数目或结构的异常，会影响胚胎的正常发育，使其停止发育形成空囊，但由于胚胎自身的生物学特性，可能不会立即引发子宫收缩促使其流产。例如，大量研究表明，约50%-60%的早期自然流产是由于染色体异常引起的，其中空囊情况中染色体异常占比较高。不同年龄阶段的人群，染色体异常的发生率有所不同，一般来说，随着女性年龄增长，卵子质量下降，染色体异常的风险增加，35岁以上女性染色体异常导致空囊等流产情况的概率明显高于年轻女性。
母体因素
内分泌因素：
黄体功能不全：黄体分泌的孕激素对于维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕激素分泌不足，不能为胚胎的着床和发育提供良好的内分泌环境，就可能导致胚胎发育异常形成空囊。研究发现，黄体功能不全的女性发生空囊且不自行流产的概率相对较高。不同生活方式的女性，如长期熬夜、压力过大等可能会影响内分泌系统，进一步加重黄体功能不全的风险，从而使空囊难以自行流产。
甲状腺功能异常：甲状腺激素参与人体的新陈代谢和生长发育调节。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的发育进程，导致空囊形成。而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会对妊娠产生不利影响，增加空囊不自行流产的可能性。有甲状腺疾病病史的女性，在妊娠期间需要密切监测甲状腺功能，因为既往的病史可能影响当前妊娠中空囊的发展情况。
免疫因素：
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击胚胎组织，导致胚胎发育异常成为空囊。但由于自身免疫反应的复杂性，胚胎可能不会马上触发母体强烈的流产反应而自行排出。患有自身免疫性疾病的女性在妊娠后，需要特别关注自身免疫状态对妊娠的影响，这类女性发生空囊不自行流产的风险相对较高，且不同病情严重程度的自身免疫性疾病患者，风险程度有所差异。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受异常时，母体免疫系统可能将胚胎视为异物进行攻击，影响胚胎发育形成空囊。这种情况下，空囊也可能不会立即引发自身的流产机制。不同个体的免疫耐受情况不同，一些有过多次不良妊娠史的女性，可能存在同种免疫异常的情况，导致空囊不自行流产的概率增加。
子宫因素
子宫解剖结构异常：
子宫畸形：如纵隔子宫、双角子宫等子宫畸形情况，会影响子宫内的环境，使胚胎着床和发育受到限制，容易出现胚胎发育异常形成空囊。而且由于子宫结构的异常，子宫收缩可能无法有效地促使空囊排出。不同类型的子宫畸形对妊娠的影响程度不同，纵隔子宫相对来说对妊娠的影响可能更为明显，这类女性在妊娠后发生空囊不自行流产的风险较高，并且需要根据子宫畸形的具体情况来评估后续的妊娠处理方式。
子宫肌瘤：较大的子宫肌瘤可能会影响子宫的血供和宫腔形态，干扰胚胎的正常发育，导致空囊形成。当子宫肌瘤的位置、大小等因素影响胚胎发育后，空囊可能不会轻易自行流产。有子宫肌瘤病史的女性，在妊娠前需要评估肌瘤对妊娠的影响，妊娠后要密切监测肌瘤和胚胎的情况，不同大小、位置的子宫肌瘤对空囊是否自行流产的影响不同，较大的黏膜下肌瘤可能会显著增加空囊不自行流产的风险。
环境因素
化学物质接触：长期接触某些化学物质，如苯、甲醛等，可能会对胚胎造成损害，导致胚胎发育异常成为空囊。但由于接触的剂量、时间等因素不同，胚胎的反应也不同，有些情况下空囊可能不会马上引发流产。从事化工行业等长期接触有害化学物质的人群，在妊娠后发生空囊不自行流产的风险相对较高，不同化学物质的毒性不同，接触高浓度有害化学物质的女性，空囊不自行流产的概率更大。
辐射暴露：过量的辐射暴露，如长时间接触X射线等，会损伤胚胎的细胞，影响胚胎发育形成空囊。辐射对胚胎的影响程度与辐射剂量和暴露时间有关，在妊娠期间有过辐射暴露史的女性，空囊不自行流产的风险增加，不同孕周时的辐射暴露对胚胎的影响不同，早期妊娠时胚胎对辐射更为敏感，此时的辐射暴露更容易导致空囊且不自行流产。
