骨骼系统损害致婴幼儿颅骨软化、方颅、前囟闭合延迟、胸部及下肢骨骼畸形等影响发育形态，肌肉力量减弱致大运动发育落后、腹部膨隆等影响运动功能，神经精神症状致易激惹、烦闹、多汗、枕部秃发等影响睡眠及发育，免疫功能低下致易感染形成恶性循环，整体生长迟缓致身高体重低于同龄儿影响身心健康及长远状况。
影响骨骼发育形态：佝偻病会导致患儿骨骼生长异常，婴幼儿时期常见颅骨软化，表现为颅骨变薄、按压时有乒乓球样感觉，6月龄以内婴儿颅骨软化较易出现；随着病情发展，会出现方颅，即额骨、顶骨双侧向双侧对称隆起，头颅变成方形；前囟闭合延迟，正常婴儿前囟在1-1.5岁闭合，佝偻病患儿可能延迟至2-3岁闭合；胸部骨骼也会受累，1岁左右婴儿可出现肋骨串珠，表现为肋骨与肋软骨交界处膨大如珠，以第7-10肋明显；还可出现鸡胸或漏斗胸，鸡胸是胸骨向前突出，形似鸡的胸脯，漏斗胸则是胸骨中下部分向内凹陷，形似漏斗；下肢骨骼畸形常见于会行走后婴幼儿，可出现膝内翻（O型腿）或膝外翻（X型腿），严重影响患儿的肢体功能和外观，对于年龄较小的患儿，骨骼处于不断生长发育阶段，畸形可能会随着生长进一步加重，而大龄儿童骨骼生长相对缓慢但畸形一旦形成也会对其日常活动造成明显限制，比如行走困难、容易疲劳等。
影响肌肉运动功能
导致肌肉力量减弱：由于维生素D缺乏影响钙磷代谢，使得肌肉的兴奋性改变，患儿会出现肌肉松弛的表现，比如抬头、坐、站、走等大运动发育落后于正常儿童，6个月以内婴儿正常情况下能较好抬头，佝偻病患儿可能抬头延迟；会坐、会站、会走的时间都比正常儿童晚；由于腹部肌肉无力，还可出现腹部膨隆如蛙腹的情况，这会进一步影响患儿的运动能力和身体姿势的维持，对于婴儿期的患儿，肌肉力量不足会影响其自主活动的开展，而随着年龄增长到幼儿期及以后，肌肉力量弱不仅会影响正常的行走、奔跑等活动，还可能因为姿势异常增加意外伤害的风险，比如站立或行走不稳容易摔倒等。
对神经系统的影响
引起神经精神症状：多见于6个月以内的小婴儿，主要表现为神经兴奋性增高，如易激惹、烦闹、多汗，与室温无关的多汗尤其头部明显，因为汗液刺激，患儿常摇头擦枕，导致枕部秃发，这些神经精神症状会影响患儿的睡眠，使患儿睡眠不安稳，进而影响其生长发育，因为睡眠是生长激素分泌的重要时期，睡眠不佳会干扰生长激素的正常分泌，对于婴儿来说，长期的神经精神症状会影响其整体的健康状态和生活质量，而且这种神经兴奋性增高的表现可能会持续存在，如果不及时纠正佝偻病，会对患儿的心理发育也产生一定影响，比如因为睡眠不好、易烦躁等可能导致患儿情绪不佳等情况。
免疫功能低下
增加感染风险：佝偻病患儿的免疫功能会受到影响，机体抵抗力下降，容易发生各种感染性疾病，如呼吸道感染、消化道感染等。这是因为维生素D缺乏会影响免疫细胞的功能和免疫球蛋白的合成等，使得患儿抵御病原体的能力减弱，对于婴幼儿来说，本身免疫系统发育尚未完善，再加上佝偻病导致的免疫功能低下，更容易频繁遭受感染，而反复的感染又会进一步影响患儿的生长发育，形成恶性循环，比如呼吸道感染会导致患儿咳嗽、发热等，影响其进食和睡眠，进而阻碍营养物质的摄入和生长激素的分泌，对患儿的健康造成多方面的不良影响。
对生长发育的全面影响
整体生长迟缓：由于佝偻病影响了骨骼发育、肌肉功能以及营养物质的代谢等多个方面，会导致患儿整体生长发育迟缓，身高、体重等指标可能低于同龄正常儿童。在身高方面，骨骼生长异常会直接影响身高的增长速度和最终身高；体重方面，因为肌肉力量弱、进食可能受影响等因素，也会出现体重增长缓慢的情况，这对患儿的身心健康都有重要影响，不仅在当下表现为体格发育落后，从长远来看还可能影响其成年后的身高和身体状况等，比如可能导致成年后身高较矮等问题，而且生长发育迟缓还会使患儿在社会交往等方面可能因为自身体格与同龄儿童不同而产生心理压力等。
