扁平疣的治疗方案包括药物治疗、物理治疗等。
一、药物治疗
1.维A酸类药物
如维A酸乳膏等，可促进表皮细胞更新，调节表皮增殖和分化，从而达到去除疣体的作用，其通过影响角质形成细胞的代谢过程发挥功效，有相关临床研究证实其对扁平疣有一定治疗效果。
2.免疫调节剂
例如干扰素凝胶，可通过调节机体免疫功能，增强免疫系统对病毒的清除作用，进而帮助消除扁平疣。
二、物理治疗
1.冷冻治疗
利用低温（通常为液氮）使疣体组织坏死、脱落，操作相对简便，通过低温破坏疣体细胞结构来实现治疗目的，有临床数据表明一定疗程的冷冻治疗对扁平疣有较好的清除率，但可能需要多次治疗。
2.激光治疗
运用高能激光束烧灼疣体，使其碳化、脱落，能精准破坏疣体组织，治疗过程相对快捷，但术后需注意创面护理，避免感染等情况，相关研究显示激光治疗扁平疣的有效率较高。
3.电灼治疗
通过电灼仪产生的高频电流烧灼疣体，使其坏死脱落，适用于较小的扁平疣，治疗时需注意控制深度，防止遗留瘢痕等问题。
对于单个较大且药物、物理治疗效果不佳的扁平疣，可考虑手术切除，但手术治疗创伤相对稍大，术后需关注伤口愈合情况，预防感染等并发症。
