性功能障碍的评估包括病史采集、体格检查、实验室检查和特殊检查。病史采集需了解一般信息、性功能细节、伴随症状、用药史和生活方式；体格检查包括全身检查（生命体征、第二性征、心血管、神经系统）和生殖器检查（阴茎、阴囊睾丸、前列腺）；实验室检查有血液（性激素、血糖血脂肝肾功能、甲状腺功能）和尿液检查；特殊检查包括阴茎海绵体血流检测、夜间阴茎勃起监测、阴茎海绵体造影、神经电生理检查。
性功能相关细节：详细询问性功能障碍的具体表现，如勃起功能障碍的发生时间、起病急缓、持续时间、严重程度（如能否勃起、勃起硬度如何、能否维持性交等）；射精功能障碍方面，包括射精延迟、早泄、不射精等情况的发生频率及特点；性欲状况，如性欲减退的程度、持续时间等。同时要询问是否有伴随症状，如是否伴有尿频、尿急、尿痛、排尿困难等泌尿系统症状，是否伴有腰膝酸软、乏力等全身症状，是否有糖尿病、高血压等慢性疾病病史，因为这些慢性疾病可能是导致性功能障碍的基础疾病。还需了解患者的用药史，是否正在服用可能影响性功能的药物，如降压药、抗抑郁药等。另外，患者的生活方式也很重要，如是否吸烟、饮酒，吸烟的量和饮酒的频率；是否有熬夜、缺乏运动等不良生活习惯；是否有心理压力过大、焦虑、抑郁等心理问题。
体格检查
全身检查：测量身高、体重、血压、心率等基本生命体征。检查第二性征，如毛发分布（包括胡须、阴毛、腋毛等）、乳房发育情况等，第二性征异常可能提示内分泌等方面的问题。检查心血管系统，了解血管搏动等情况，因为阴茎勃起依赖于正常的血管充血机制，心血管疾病可能影响阴茎血流。检查神经系统，包括感觉神经和运动神经的功能，如阴茎感觉减退等可能提示神经源性性功能障碍。
生殖器检查：检查阴茎的外观，包括阴茎的大小、形态、有无畸形、外伤瘢痕等；检查阴囊及睾丸，了解睾丸的大小、质地、有无压痛、附睾是否正常等，睾丸是产生精子和雄激素的重要器官，其异常可能影响性功能和生育功能；检查前列腺，通过直肠指诊了解前列腺的大小、质地、有无结节等，前列腺疾病可能影响性功能。
实验室检查
血液检查
性激素水平测定：包括睾酮、雌二醇、促黄体生成素、促卵泡生成素等。睾酮是维持男性性功能的重要激素，睾酮水平降低可能导致性欲减退、勃起功能障碍等。一般在早晨空腹状态下采血，不同年龄段正常参考值不同，老年男性睾酮水平通常会有所下降。
血糖、血脂、肝肾功能检查：糖尿病可引起血管和神经病变，导致性功能障碍，所以血糖检测很重要；高血脂可能影响血液循环，进而影响阴茎血流；肝肾功能异常可能影响药物代谢及体内激素等的平衡，从而影响性功能。
其他相关激素及指标：如甲状腺功能相关指标，甲状腺功能异常也可能导致性功能障碍。
尿液检查：检查尿常规等，了解是否有泌尿系统感染等情况，泌尿系统感染可能引起性功能方面的不适。
特殊检查
阴茎海绵体血流检测：如彩色多普勒超声检查，可了解阴茎海绵体动脉的血流速度、血流情况等，评估阴茎的血管功能，对于血管性勃起功能障碍的诊断有重要意义。
夜间阴茎勃起监测：通过监测夜间睡眠状态下阴茎的勃起情况，区分是心理性还是器质性勃起功能障碍。如果夜间有正常的勃起，多考虑心理性因素；如果夜间也无有效勃起，则提示可能存在器质性病变。
阴茎海绵体造影：对于怀疑有阴茎海绵体血管畸形等情况的患者，可进行阴茎海绵体造影检查，了解海绵体血管的形态等情况。
神经电生理检查：如阴茎背神经体感诱发电位等检查，可评估阴茎神经的功能，对于神经源性性功能障碍的诊断有帮助。
