消化不良的因素包括饮食方面婴儿期喂养量不当或母亲饮食结构不合理、幼儿及儿童期饮食不规律等，胃肠道功能婴儿阶段发育未完善消化能力弱，感染因素有病毒如轮状、诺如病毒感染及细菌如大肠杆菌、沙门菌感染，其他因素有环境中温度变化、气候变化影响及过敏中食物过敏致胃肠消化功能受影响等。
一、饮食因素
（一）喂养不当
1.婴儿期：对于婴儿，尤其是6个月-1岁的宝宝，若喂养量过多或过少都可能导致消化不良。例如过量喂养配方奶，超过婴儿胃肠道的消化和吸收能力，会使食物在胃肠内不能被充分消化分解，从而引起消化不良。母乳喂养的婴儿，如果母亲饮食结构不合理，如摄入过多高脂、高糖食物，通过乳汁传递给婴儿，也可能影响婴儿消化功能。
2.幼儿及儿童期：幼儿和儿童可能存在饮食不规律的情况，如暴饮暴食，短时间内大量进食，胃肠道来不及分泌足够的消化液来消化食物；或者挑食、偏食，导致营养摄入不均衡，缺乏某些维生素（如维生素B族等）和矿物质，影响胃肠道的正常消化功能。例如长期挑食蔬菜的儿童，容易因膳食纤维摄入不足，胃肠蠕动减慢，出现消化不良。
二、胃肠道功能发育不成熟
（一）婴儿阶段
婴儿的胃肠道发育尚未完善，胃酸和消化酶的分泌量相对较少，活性较低，对食物的消化能力较弱。例如3个月以内的婴儿，胃呈水平位，且食管下括约肌松弛，容易出现溢奶现象，同时消化酶分泌不足，对蛋白质等大分子物质的消化能力有限，当摄入较多蛋白质类食物时，就更易发生消化不良。随着婴儿月龄增长，胃肠道功能会逐渐完善，但在婴幼儿时期仍相对较弱。
三、感染因素
（一）病毒感染
1.轮状病毒：是引起婴幼儿腹泻的常见病原体之一，也常伴有消化不良症状。轮状病毒感染后，主要侵犯小肠绒毛上皮细胞，导致绒毛萎缩、变短，影响肠道的消化和吸收功能，使患儿出现腹泻、呕吐、腹胀、食欲不振等消化不良表现。多见于6个月-2岁的婴幼儿，在秋冬季节高发。
2.诺如病毒：可引起儿童和成人的急性胃肠炎，感染后患儿胃肠道功能紊乱，出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，同时伴有消化不良。诺如病毒传染性较强，可通过污染的食物、水等传播，各年龄段儿童均可感染，但以学龄前儿童相对更易受影响。
（二）细菌感染
1.大肠杆菌：某些致病性大肠杆菌感染肠道后，会产生毒素，损伤肠黏膜，影响肠道的消化吸收功能。患儿可出现腹泻、腹痛、腹胀等消化不良症状，大便可能伴有黏液、脓血等。儿童感染大肠杆菌的途径多为食用被污染的食物或水。
2.沙门菌：沙门菌感染胃肠道后，可引起急性肠炎，导致肠道炎症反应，影响消化功能。患儿表现为发热、腹痛、腹泻、恶心、呕吐等，其中腹泻可为稀水便、黏液便等，同时存在消化不良情况。儿童感染沙门菌常见于食用了被污染的蛋类、肉类等食物。
四、其他因素
（一）环境因素
1.温度变化：儿童腹部着凉时，胃肠道血管收缩，导致胃肠蠕动减慢，消化液分泌减少，从而引起消化不良。例如在季节更替时，气温下降，儿童没有及时增添衣物，腹部保暖不当，就容易出现消化不良症状，表现为腹痛、腹胀、食欲减退等。
2.气候变化：潮湿、寒冷的环境可能影响儿童的胃肠道功能。长期处于这样的环境中，儿童的消化功能可能会受到一定影响，出现消化不良情况。比如南方梅雨季节，空气湿度大，儿童可能会出现胃肠不适、消化不良。
（二）过敏因素
1.食物过敏：部分儿童对某些食物过敏，如牛奶蛋白过敏、花生过敏等。以牛奶蛋白过敏为例，儿童摄入牛奶后，机体的免疫系统将牛奶蛋白视为外来的有害物质，产生免疫反应，影响胃肠道的正常消化功能，出现呕吐、腹泻、腹胀、便血等症状，同时伴有消化不良表现。牛奶蛋白过敏在婴儿期较为常见，约占6个月以下婴儿食物过敏的50%左右。
