囊腺瘤病因未完全明确，可能与遗传因素（家族遗传综合征相关基因变异可增发病风险，不同年龄、生活方式及有相关病史人群发病风险不同）、内分泌因素（内分泌紊乱参与，女性不同生理阶段、男性雌激素异常及不同年龄、生活方式、有内分泌疾病史人群易受影响）、组织损伤与修复（局部组织损伤后修复异常可致，不同性别、年龄、生活方式及有局部损伤病史人群相关）、慢性炎症刺激（长期慢性炎症刺激为诱因，不同性别、年龄、生活方式及有慢性炎症病史人群受影响）有关。
遗传因素：某些遗传综合征可能增加囊腺瘤的发病风险。例如，在一些家族性的遗传疾病中，相关基因的突变可能导致细胞异常增殖，进而引发囊腺瘤。有研究发现，特定染色体上的基因变异与某些类型囊腺瘤的发生存在关联，但具体的遗传模式和相关基因的作用机制仍在进一步研究中。不同性别在遗传易感性上可能没有明显的特异性差异，但家族中有相关遗传病史的人群，其发病风险相对较高。年龄方面，任何年龄段都可能受到遗传因素影响而发病，但不同年龄阶段的具体发病机制可能因身体发育和基因表达等情况有所不同。生活方式与遗传因素相互作用，不健康的生活方式可能会在遗传易感性的基础上，进一步影响身体的内环境，增加囊腺瘤的发病几率。有相关病史的人群，如家族中有亲属患类似囊腺瘤疾病，其自身发病风险高于普通人群，需要更加密切地进行健康监测。
内分泌因素：内分泌紊乱可能参与囊腺瘤的发生发展。例如，雌激素水平的异常变化可能对某些组织的细胞生长产生影响。在女性中，月经周期、妊娠、绝经等生理阶段的内分泌变化较为显著，这些变化可能与某些女性生殖系统相关的囊腺瘤发生有关。男性体内雌激素水平异常也可能与相应部位囊腺瘤的发生存在一定关联。不同年龄的人群，内分泌状态不同，青少年时期内分泌系统尚未完全稳定，可能因内分泌波动增加囊腺瘤发病风险；育龄女性内分泌变化复杂，也是囊腺瘤的高发人群之一；中老年人群内分泌功能逐渐衰退，同样可能受到内分泌因素影响导致囊腺瘤发生。生活方式中，长期的精神压力、不合理的饮食等可能干扰内分泌平衡，增加囊腺瘤发病风险。有内分泌疾病病史的人群，如甲状腺功能异常等，其内分泌环境与常人不同，更易引发囊腺瘤。
组织损伤与修复：局部组织受到损伤后，机体的修复过程可能出现异常，从而导致囊腺瘤的形成。例如，炎症刺激、手术创伤等因素引起组织反复损伤，在修复过程中细胞异常增殖，逐渐形成囊腺瘤。不同性别在组织损伤后的修复反应可能存在一定差异，这可能与激素水平等因素有关。年龄较小的人群组织修复能力较强，但如果损伤因素持续存在，也可能影响修复过程导致囊腺瘤；中老年人群组织修复能力下降，损伤后更易出现修复异常情况。生活方式中，频繁的局部组织损伤相关行为，如反复的局部炎症刺激等，会增加囊腺瘤发病风险。有局部组织损伤病史的人群，如曾有过局部手术史、反复炎症史等，需要关注局部组织的健康状况，警惕囊腺瘤的发生。
慢性炎症刺激：长期的慢性炎症刺激是囊腺瘤发生的一个重要诱因。例如，胆道系统的慢性炎症可能与胆道囊腺瘤的发生相关，肠道的慢性炎症也可能与肠道囊腺瘤的发生存在联系。炎症过程中会释放一些细胞因子等物质，刺激细胞异常增殖和分化，逐渐形成囊腺瘤结构。不同性别在慢性炎症的易感性和表现上可能没有明显性别差异，但某些慢性炎症疾病在不同性别中的发病率不同，可能间接影响囊腺瘤的发病情况。年龄方面，任何年龄都可能受到慢性炎症刺激而发病，但儿童时期免疫系统尚未完全成熟，更容易受到慢性炎症影响；中老年人群由于身体机能下降，慢性炎症更易持续存在，增加囊腺瘤发病风险。生活方式中，长期吸烟、饮酒等不良生活习惯可能加重慢性炎症反应，进而增加囊腺瘤发病风险。有慢性炎症病史的人群，如慢性胆囊炎、慢性肠炎等患者，需要积极治疗炎症，定期进行相关检查，以便早期发现和处理可能出现的囊腺瘤。
