婴儿消化不良可能由饮食因素如喂养不当、食物过敏或不耐受引起，消化系统发育不成熟在婴儿期及年龄增长后有不同表现，疾病因素包括感染因素（肠道及其他系统感染）和其他疾病（先天性消化道畸形、内分泌及代谢性疾病），环境及其他因素有环境温度变化、精神心理因素影响。
一、饮食因素
1.喂养不当
婴儿期：对于婴儿来说，若母乳喂养时，母亲饮食不注意，食用过多油腻、辛辣等刺激性食物，可能通过乳汁影响婴儿。人工喂养的婴儿，若奶粉冲泡浓度不合适，过浓会增加婴儿消化负担，过稀则不能满足婴儿营养需求同时可能导致摄入能量不足，但更主要是浓度不当引发消化问题；添加辅食阶段，过早添加不易消化的食物，如过早添加大块肉类、硬果类等，婴儿的消化系统尚未发育完善，难以消化这些食物，就容易引起消化不良。例如，有研究表明，过早引入固体食物的婴儿，发生消化不良的概率相对较高。
幼儿及儿童期：儿童如果暴饮暴食，短时间内摄入大量食物，超过了胃肠道的消化吸收能力，胃肠道需要超负荷工作来消化这些食物，就容易导致消化不良。另外，长期挑食、偏食，会造成营养摄入不均衡，影响胃肠道正常的消化功能。比如只爱吃肉类，不爱吃蔬菜和水果的孩子，容易出现膳食纤维摄入不足，进而影响肠道蠕动，引发消化不良。
2.食物过敏或不耐受
部分宝宝可能对某些食物过敏或不耐受，常见的如牛奶蛋白过敏、小麦过敏等。以牛奶蛋白过敏为例，宝宝摄入牛奶后，免疫系统会将牛奶蛋白视为外来的有害物质，发起免疫反应，从而影响胃肠道的正常消化功能，出现呕吐、腹泻、腹胀、腹痛等消化不良的表现。据统计，约有2%-7%的婴儿存在牛奶蛋白过敏情况，其中部分婴儿会以消化不良为主要症状表现。
二、消化系统发育不成熟
1.婴儿期：婴儿的胃肠道相对较娇嫩，胃肠道的消化酶分泌不足，尤其是胰蛋白酶、淀粉酶等，这些酶对于食物的消化起着重要作用，酶分泌不足会导致食物消化不完全。例如，婴儿的胰腺分泌淀粉酶的量较少，对淀粉类食物的消化能力较弱，如果摄入较多淀粉类食物，就容易出现消化不良。而且婴儿的胃肠道蠕动功能也不完善，胃肠道蠕动不协调会影响食物的正常推进和消化吸收过程。
2.年龄增长后的发育特点：随着宝宝年龄的增长，消化系统会逐渐发育完善，但在这个过程中，仍可能因为个体差异等因素出现暂时性的消化功能不稳定情况。比如幼儿期的宝宝，虽然消化系统比婴儿期有所发展，但相较于成人还是较为脆弱，在饮食稍有变化时就可能出现消化不良。
三、疾病因素
1.感染因素
肠道感染：宝宝如果感染了病毒（如轮状病毒、诺如病毒等）或细菌（如大肠杆菌、沙门氏菌等），引起肠道炎症，会影响肠道的消化和吸收功能。例如轮状病毒感染，主要侵犯小肠上皮细胞，导致肠黏膜受损，绒毛萎缩，影响消化酶的活性和食物的吸收，从而出现腹泻、呕吐、腹痛等消化不良相关症状，轮状病毒肠炎在婴幼儿中较为常见，是引起婴幼儿消化不良性腹泻的重要原因之一。
其他系统感染：宝宝如果患有上呼吸道感染等其他系统的感染性疾病，也可能影响胃肠道功能。这是因为感染引起的发热、毒素释放等因素会影响胃肠道的蠕动和消化酶的分泌，导致宝宝出现食欲减退、消化不良等表现。比如宝宝感冒发热时，常常会伴有食欲不振、腹胀等消化不良的症状。
2.其他疾病
先天性消化道畸形：一些宝宝可能存在先天性消化道畸形，如先天性肥厚性幽门狭窄，主要表现为幽门括约肌肥厚、增生，导致幽门管腔狭窄，引起胃排空障碍，宝宝会出现频繁呕吐、上腹部可见胃蠕动波等症状，属于先天性的消化不良相关疾病，需要通过手术等方式进行治疗。
内分泌及代谢性疾病：某些内分泌及代谢性疾病也可能影响宝宝的消化功能，如甲状腺功能减退症，甲状腺激素分泌不足会导致机体代谢率降低，胃肠道蠕动减慢，消化液分泌减少，从而出现食欲减退、腹胀、便秘等消化不良的表现。
四、环境及其他因素
1.环境温度变化：宝宝的腹部如果着凉，会引起胃肠道平滑肌痉挛，影响胃肠道的正常蠕动和消化功能。比如在寒冷的季节，宝宝没有做好腹部保暖，就容易出现消化不良的情况。另外，环境温度过高时，宝宝的消化酶活性也可能受到一定影响，导致消化功能下降。
2.精神心理因素：对于较大的宝宝，精神紧张、焦虑等情绪也可能影响消化功能。例如，宝宝在更换抚养环境、受到惊吓等情况下，可能会出现短期的消化不良，表现为食欲不佳、腹胀等。这是因为不良的情绪会通过神经内分泌系统影响胃肠道的运动和消化液的分泌，从而干扰正常的消化过程。
