咽峡炎局部症状有咽痛（程度可轻可重，病毒感染咽痛明显吞咽时加剧，细菌感染咽痛可能更剧烈）、咽部充血（病毒感染相对轻，细菌感染更明显可伴点状或片状出血）、咽峡部疱疹或溃疡（疱疹性咽峡炎有散在灰白色疱疹后变溃疡，樊尚咽峡炎是单侧咽峡部溃疡伴灰白色假膜）；全身症状有发热（病毒感染多低热或中度发热、持续短，细菌感染多高热、持续长）、乏力（感染致代谢紊乱机体应激消耗增加所致随病情好转减轻）、头痛（发热明显时可出现，程度因人而异）；不同人群有特点，儿童表现更烦躁不安、病情变化快，老年人全身症状不典型易有并发症且可加重基础病，免疫力低下人群症状更严重、病程长、易反复感染治疗难。
咽痛：是咽峡炎最常见的局部症状之一，程度可轻可重，轻者仅感咽部不适，重者则疼痛较为剧烈，甚至吞咽困难。例如病毒感染引起的咽峡炎，患者常诉咽痛明显，尤其是在吞咽时疼痛加剧。一般来说，细菌感染导致的咽峡炎咽痛可能相对更剧烈，有的患者甚至会因为咽痛而不敢进食。
咽部充血：检查时可见咽部黏膜弥漫性充血，颜色鲜红。不同病因引起的咽峡炎咽部充血程度可能有所差异，病毒感染引起的咽峡炎咽部充血可能相对较轻，而细菌感染引起的咽峡炎咽部充血往往更为明显，有时还可伴有黏膜下的点状或片状出血。
咽峡部疱疹或溃疡：某些特定病原体感染引起的咽峡炎会出现特殊的局部表现。比如疱疹性咽峡炎，由柯萨奇病毒A组引起，在咽峡部会出现散在的灰白色疱疹，周围绕以红晕，直径1-2mm，数日后疱疹破溃变为溃疡；而樊尚咽峡炎则表现为单侧咽峡部有溃疡，覆盖有灰白色假膜，周围黏膜充血。
全身症状
发热：不同类型的咽峡炎发热情况有所不同。病毒感染引起的咽峡炎多为低热或中度发热，体温一般在37.5-38.5℃左右，持续时间相对较短，多数在1-2天内体温可逐渐恢复正常，但也有少数病毒感染引起的咽峡炎可能出现高热，体温超过39℃。细菌感染引起的咽峡炎往往会出现高热，体温可迅速升高到39℃甚至更高，而且发热持续时间相对较长，如果不进行有效的抗感染治疗，发热可能会反复。例如A组乙型溶血性链球菌引起的咽峡炎，常伴有高热，体温可达39℃以上，且发热持续时间较长，可能会持续3-5天甚至更久。
乏力：患者会感觉全身没有力气，活动耐力下降。无论是病毒还是细菌感染引起的咽峡炎，都可能出现乏力症状。这是因为感染导致身体的代谢紊乱，机体处于应激状态，消耗增加，从而使患者感到乏力。一般来说，随着咽峡炎病情的好转，乏力症状也会逐渐减轻。
头痛：部分患者会出现头痛症状，尤其是在发热比较明显的时候。头痛的程度因人而异，有的患者可能只是轻微头痛，而有的患者头痛较为剧烈。其发生机制可能与发热引起脑血管扩张、代谢产物积聚等因素有关。
不同人群咽峡炎症状特点
儿童：儿童咽峡炎时除了上述局部和全身症状外，还可能表现得更为烦躁不安。因为儿童表达能力相对较弱，可能会通过哭闹等方式来表达咽部的不适。而且儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，感染后病情变化可能较快，比如发热可能更容易出现高热惊厥等情况。例如疱疹性咽峡炎在儿童中较为常见，儿童可能会突然出现高热，同时咽部疱疹引起的不适会让儿童进食明显减少，精神状态也会受到一定影响。
老年人：老年人咽峡炎时，全身症状可能相对不典型，发热程度可能不如年轻人明显，但是机体的抵抗力较差，容易出现并发症，如肺炎、心肌炎等。而且老年人本身可能患有多种基础疾病，咽峡炎可能会加重这些基础疾病的病情。例如老年人有冠心病病史，咽峡炎引起的发热、乏力等可能会增加心脏的负担，诱发心绞痛等心脏疾病发作。
免疫力低下人群：如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的患者等，咽峡炎的症状可能更为严重，病程更长，而且容易反复感染。病原体可能更顽固，治疗难度相对较大。因为这类人群的免疫系统功能受损，无法有效地对抗病原体，所以咽部的炎症反应可能持续存在，局部的疱疹、溃疡等表现可能更难愈合，全身症状也会更为突出。
