自酿葡萄酒中毒与微生物污染（霉菌污染及酵母菌异常繁殖产毒）、甲醇含量过高（葡萄自身因素及发酵工艺因素）、二氧化硫残留问题（添加不当）相关，其中微生物污染会因不同人群耐受性等致不同中毒表现，甲醇含量过高因葡萄自身及发酵工艺等对不同人群器官有损害，二氧化硫残留不当会对特殊人群如哮喘患者有不良影响及致其他人群胃肠道不适。
自酿葡萄酒中毒主要与以下原因相关：
一、微生物污染导致的中毒
1.霉菌污染
自酿葡萄酒过程中，如果容器、葡萄等受到霉菌污染，霉菌会在发酵过程中产生毒素。例如，某些霉菌可产生展青霉素等毒素。展青霉素对人体的神经系统、消化系统等有不良影响。葡萄在采摘、运输等环节若保存不当，受到霉菌污染，在自酿时霉菌会在无氧或低氧的发酵环境中生长繁殖并产生毒素。
对于不同年龄、性别的人群，霉菌毒素的毒性表现可能有所不同。一般来说，儿童由于身体各项机能尚未发育完全，对霉菌毒素的耐受性更差，更容易出现中毒相关的不适症状，如恶心、呕吐等；而成年人相对耐受能力稍强，但长期摄入含霉菌毒素的自酿葡萄酒也会对健康造成累积性损害。有基础疾病的人群，如肝脏疾病患者，肝脏的解毒功能下降，更容易受到霉菌毒素的影响，中毒后病情可能更严重。
2.酵母菌异常繁殖产生毒素
虽然酵母菌是葡萄酒发酵的主要菌种，但如果发酵条件控制不当，可能会导致酵母菌异常繁殖并产生毒素。例如，发酵温度、酸碱度等条件不合适时，酵母菌的代谢途径可能发生改变，产生一些对人体有害的代谢产物。在自酿过程中，如果发酵容器密封不严，或者发酵时间过长等，都可能导致酵母菌的异常代谢，产生毒素。
对于生活方式不同的人群，如长期大量饮酒的人群，自酿葡萄酒中的异常酵母菌毒素更容易对其肝脏等器官造成损害；而偶尔自酿葡萄酒饮用的人群，若不慎饮用了含有异常酵母菌毒素的自酿葡萄酒，也可能在短时间内出现中毒反应，如头晕、乏力等症状。
二、甲醇含量过高引起的中毒
1.葡萄自身因素
葡萄中的果胶在一定条件下会分解产生甲醇。如果葡萄本身成熟度不够或者受到损伤等，果胶分解产生甲醇的量会增加。未成熟的葡萄中果胶含量相对较高，在自酿过程中更容易产生较多的甲醇。
不同品种的葡萄其果胶含量不同，一些品种的葡萄可能本身就含有相对较高的果胶，在自酿时就更易产生较多甲醇。对于年龄较小的儿童，由于其身体代谢甲醇的能力较弱，即使摄入少量甲醇也可能导致中毒症状，如视力模糊等；而成年人代谢甲醇的能力相对较强，但长期饮用甲醇含量过高的自酿葡萄酒也会对眼睛等器官造成损害，影响视力等。
2.发酵工艺因素
自酿葡萄酒时，如果发酵温度控制不当，会影响甲醇的产生量。一般来说，较高的发酵温度会促进甲醇的产生。例如，发酵温度过高时，葡萄中的果胶分解产生甲醇的反应会加快，导致甲醇含量升高。在自酿过程中，如果没有合适的温度控制设备，很难精确控制发酵温度，容易导致甲醇含量超标。
生活方式中经常大量摄入酒精类饮品的人群，自酿葡萄酒中的甲醇更容易对其神经系统等造成损害；而生活方式较为健康、很少接触酒精类饮品的人群，摄入甲醇含量过高的自酿葡萄酒后，中毒症状可能更为明显，如头痛、恶心等症状出现得更迅速。
三、二氧化硫残留问题
1.添加不当
在自酿葡萄酒过程中，如果添加二氧化硫的量不合适，可能会导致残留量过高引起中毒。如果添加二氧化硫的时间、方法不正确，比如添加过早，二氧化硫可能在发酵前期就大量挥发，但如果添加量过多且分布不均匀，就会导致残留量过高。
对于特殊人群，如哮喘患者，二氧化硫可能会诱发哮喘发作。哮喘患者本身呼吸道比较敏感，自酿葡萄酒中残留的二氧化硫可能刺激呼吸道，引起呼吸困难等严重的过敏反应；而其他人群如果摄入二氧化硫残留过高的自酿葡萄酒，也可能出现恶心、呕吐、腹痛等胃肠道不适症状。
