导致矮小症的因素众多，包括遗传因素，家族有矮小症遗传病史后代风险增加；内分泌因素，生长激素缺乏或分泌不足、甲状腺功能减退可致矮小；营养因素，营养摄入不足或过剩均会影响；疾病因素，慢性疾病及骨骼疾病会引发；还有环境因素，不良生活环境不利生长，心理因素，长期精神压抑影响生长激素分泌。
内分泌因素
生长激素缺乏或分泌不足：生长激素是促进人体生长的重要激素。垂体前叶分泌生长激素不足会引起生长障碍。下丘脑-垂体功能异常可导致生长激素分泌减少，例如垂体发育异常、颅内肿瘤等病变可能影响垂体分泌生长激素。这种情况在儿童期较为常见，会使儿童的身高增长速度明显低于正常儿童，身高低于同年龄、同性别正常儿童生长曲线的第3百分位以下。不同年龄阶段的儿童表现有所不同，婴幼儿期可能表现为生长缓慢，学走路时间延迟等；学龄期则身高增长落后更为明显。
甲状腺功能减退：甲状腺激素对生长发育也起着重要作用，它能促进蛋白质合成，促进生长发育。先天性甲状腺功能减退症如果没有及时诊断和治疗，会导致儿童身材矮小，同时还伴有智力发育迟缓等表现。甲状腺功能减退的儿童除了身高矮小外，还可能出现皮肤粗糙、面色苍黄、头发稀疏等症状。在新生儿期通过新生儿疾病筛查可以早期发现甲状腺功能减退症，及时治疗可以改善预后，不同性别在甲状腺功能减退导致的矮小症表现上差异相对不显著，但治疗时机对预后影响极大。
营养因素
营养摄入不足：儿童时期是生长发育的关键阶段，需要充足的营养供应。如果长期摄入的营养物质不能满足身体生长的需求，如蛋白质、能量、维生素、矿物质等摄入不足，会影响身高增长。例如，长期挑食、偏食的儿童，可能会缺乏某些关键营养素，从而导致身材矮小。不同生活方式的儿童，如饮食习惯不良的儿童更容易出现营养摄入不足的情况。对于营养摄入不足导致矮小症的儿童，需要调整饮食结构，保证均衡营养，多摄入富含蛋白质（如肉类、蛋类、豆类）、钙（如奶制品、豆制品）、维生素D（如鱼类、蛋黄）等有助于生长的营养素。
营养过剩：相反，营养过剩也可能引发问题。儿童期过度肥胖可能会影响内分泌功能，导致生长激素分泌相对不足等情况，进而影响身高增长。肥胖儿童可能存在胰岛素抵抗等问题，影响生长激素的正常作用途径。对于肥胖儿童，需要调整饮食结构，控制高热量、高脂肪食物的摄入，增加运动量，以维持正常的生长发育状态，不同性别在营养过剩导致矮小症的机制上可能有相似性，但肥胖对不同性别的生长发育影响可能因身体代谢等差异有一定不同表现。
疾病因素
慢性疾病：一些慢性疾病会影响儿童的生长发育，导致矮小症。例如，先天性心脏病患儿，由于长期缺氧等原因，会影响身体的正常代谢和生长；慢性肾病患儿，肾脏功能受损会影响体内激素的代谢等，从而影响身高增长。患有慢性疾病的儿童除了身高矮小外，往往还伴有原发病的相关症状，如先天性心脏病患儿可能有口唇发绀、活动耐力差等表现，慢性肾病患儿可能有水肿、蛋白尿等表现。对于患有慢性疾病的儿童，需要积极治疗原发病，同时密切监测生长发育情况，根据病情调整治疗方案以保障正常生长。
骨骼疾病：某些骨骼疾病也会导致矮小症，如软骨发育不全，这是一种先天性软骨发育障碍性疾病，主要表现为长骨短小，身材矮小，四肢短粗等。成骨不全症等骨骼发育异常疾病也会影响骨骼的正常生长和发育，导致身材矮小。骨骼疾病导致的矮小症，其临床表现主要与骨骼的病变部位和严重程度相关，不同骨骼疾病的表现各有特点，需要通过影像学等检查手段进行明确诊断，对于骨骼疾病导致的矮小症儿童，需要根据具体疾病进行针对性的治疗和干预，比如一些骨骼畸形可能需要通过手术等方法进行矫正，但手术时机和方式需要严格评估。
其他因素
环境因素：不良的生活环境可能影响儿童的生长发育。例如，长期生活在污染严重的环境中，空气中的有害物质可能会影响儿童的内分泌功能等，从而影响身高增长。居住环境过于拥挤、缺乏足够的户外活动空间等也可能对儿童的生长发育产生不利影响。不同地区的环境因素差异可能导致不同地区儿童的身高发育有所不同，对于儿童来说，营造良好的生活环境，保证充足的户外活动时间等有助于正常生长发育。
心理因素：长期的精神压抑等心理因素也可能影响儿童的生长激素分泌，从而导致身材矮小。例如，家庭关系不和睦、长期受到学习压力等精神刺激的儿童，可能会出现生长发育迟缓的情况。心理因素对儿童生长发育的影响通过影响内分泌系统来实现，不同性格特点的儿童在面对相同心理压力时的反应可能不同，但长期的不良心理状态都会对生长发育产生不利影响。对于存在心理因素影响的儿童，需要关注其心理健康，营造良好的家庭和学习环境，必要时寻求心理专业人员的帮助。
