肛瘘手术后存在复发可能，但规范治疗可显著降低复发概率。
复发与否与术前感染控制、术中瘘管处理完整性、术后护理及患者个体因素密切相关。若手术彻底清除瘘管及感染源，术后护理得当，如保持肛门清洁、饮食清淡、避免便秘等，且患者无基础疾病，复发概率较低。然而，若手术未完全切除瘘管或分支瘘管，术后护理不当，如过早剧烈运动、排便用力过度，或患者存在免疫力低下、糖尿病等基础疾病，可能增加复发风险。
临床数据显示，单纯性肛瘘术后复发率较低，而复杂性肛瘘复发率相对较高。为预防复发，术后需定期复查，及时发现并处理微小复发灶。若出现肛门肿痛、渗液等症状，应及时就医。
