流产的原因是染色体异常、胚胎发育不良、全身性疾病、生殖器官异常、免疫功能异常等。
1.染色体异常
胚胎染色体数目异常包括非整倍体，如三体、单体等；结构异常如染色体断裂、缺失、易位等。无论是父母双方哪一方的染色体携带异常，都可能传递给胚胎导致流产。例如，父母一方如果是平衡易位携带者，其孕育的胚胎很可能出现染色体不平衡，从而引发流产。从年龄角度看，女性年龄越大，卵子质量越易下降，染色体异常的概率也越高，35岁以上女性流产中染色体异常的比例明显高于年轻女性。
2.胚胎发育不良
胚胎自身基因表达异常或发育过程中受到不良因素影响，导致胚胎不能正常发育，最终引发流产。比如胚胎在着床后由于营养供应不足、受到外界化学物质（如某些农药、工业污染物等）或辐射等因素干扰，影响了正常的细胞分裂和分化过程，使得胚胎无法继续正常生长而发生流产。
3.全身性疾病
孕妇感染某些病原体，如弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等，可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎发育导致流产。例如，孕妇感染风疹病毒后，病毒可通过胎盘传播给胎儿，引起胎儿先天性白内障、耳聋、心脏畸形等，进而导致流产。全身性的严重感染，如败血症等，也会使机体处于应激状态，释放炎症因子等，影响子宫内环境，不利于胚胎着床和发育。
4.生殖器官异常
子宫畸形，如纵隔子宫、双角子宫等，会影响子宫腔的形态和容积，使胚胎着床和发育的空间受限；子宫肌瘤，尤其是黏膜下子宫肌瘤，会改变宫腔内环境，影响胚胎着床，还可能因肌瘤占位导致子宫收缩异常引发流产；宫腔粘连，多由于宫腔操作（如人工流产、刮宫等）损伤子宫内膜引起，宫腔粘连会导致宫腔有效面积减少，影响胚胎种植和发育。
5.免疫功能异常
如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，这些抗体可通过影响胎盘的血管功能等，导致胎盘血流灌注不足，从而引发流产。自身免疫性疾病的诊断需要结合患者的临床表现、自身抗体检测等多方面因素。
另外，长期接触高剂量的辐射，如X射线、放射性物质等，可导致胚胎细胞染色体断裂、基因突变等，从而引发流产。例如，在放射科工作且未做好防护措施的孕妇，流产风险明显升高。
