卵巢囊肿的形成有多种因素，包括生理性的卵泡囊肿、黄体囊肿；病理性的子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）、卵巢肿瘤（上皮性、生殖细胞、性索间质肿瘤）、炎症性卵巢囊肿；还有内分泌、生活方式、环境等其他因素，生理性囊肿多与正常周期变化相关，病理性囊肿与相应病理机制及相关因素有关，其他因素通过影响内分泌等增加囊肿发生风险。
一、生理性因素
（一）卵泡囊肿
女性每个月经周期都会有卵泡发育，正常情况下卵泡会破裂排卵，如果卵泡没有破裂，继续生长就可能形成卵泡囊肿，一般直径多在2-3厘米，通常会在几个月经周期内自行消失，多见于育龄期女性，与正常的排卵周期变化相关。
（二）黄体囊肿
排卵后卵泡壁会形成黄体，如果黄体血肿没有吸收，就会形成黄体囊肿。黄体囊肿一般在月经后半期出现，直径一般不超过3厘米，部分女性可能没有明显症状，多可自行消退，也常见于育龄期女性，与黄体期的生理变化有关。
二、病理性因素
（一）子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
1.发病机制
子宫内膜组织出现在卵巢上，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊内含有类似巧克力样的暗褐色黏稠液体。这种情况与经血逆流等因素有关，常见于育龄期有月经的女性，尤其是有多次人工流产、经期剧烈运动等情况的女性，子宫内膜异位的风险可能增加。
2.相关因素
经血逆流：经期时，子宫内膜碎片可能通过输卵管逆流进入盆腔，种植在卵巢表面并生长，逐渐形成囊肿。
遗传因素：有一定的遗传易感性，如果家族中有亲属患有子宫内膜异位症，个体发病风险可能升高。
免疫因素：自身免疫系统功能异常时，可能无法有效清除异位的子宫内膜组织，导致囊肿形成。
（二）卵巢肿瘤
1.上皮性卵巢肿瘤
浆液性肿瘤：由卵巢表面的生发上皮发生，分为浆液性囊腺瘤、交界性浆液性肿瘤和浆液性囊腺癌等。其发生可能与长期的炎症刺激、遗传等因素有关，例如BRCA1/BRCA2基因突变的女性，患浆液性卵巢癌的风险明显升高，可发生于各个年龄段，但多见于中老年女性。
黏液性肿瘤：由卵巢表面的生发上皮向宫颈黏膜分化而来，黏液性囊腺瘤较为常见，交界性黏液性肿瘤和黏液性囊腺癌相对少见，其发生也与遗传易感性等有关，同样可见于不同年龄段女性。
2.生殖细胞肿瘤
畸胎瘤：由多胚层组织构成，有成熟畸胎瘤和未成熟畸胎瘤之分，成熟畸胎瘤最为常见，可含有毛发、牙齿、油脂等多种成分，其发生可能与生殖细胞异常分化等因素有关，多见于年轻女性。
内胚窦瘤等：相对少见，多发生于儿童和年轻女性，发病机制与生殖细胞的异常发育等有关。
3.性索间质肿瘤
颗粒细胞瘤：可分泌雌激素，多见于绝经后女性，发病可能与遗传因素等有关，例如部分患者存在FOXL2基因突变等情况。
卵泡膜细胞瘤：多为良性，也可分泌雌激素，常见于绝经后女性，其发生与卵巢的性索间质细胞异常增生有关。
（三）炎症性卵巢囊肿
1.输卵管卵巢脓肿
由盆腔炎症蔓延引起，输卵管和卵巢粘连形成脓肿，常见于性活跃的育龄期女性，多有不洁性生活史、盆腔炎反复发作等情况，炎症长期刺激卵巢导致囊肿形成。
2.卵巢周围炎导致的囊肿
盆腔其他部位的炎症波及卵巢周围，引起组织粘连、包裹形成囊肿，也常见于有盆腔炎症病史的女性。
三、其他因素
（一）内分泌因素
过多的雄激素等内分泌激素异常可能影响卵巢的正常功能，导致囊肿形成。例如多囊卵巢综合征患者，常伴有卵巢多囊样改变、雄激素水平升高等，进而可能出现卵巢囊肿样改变，多见于育龄期女性，与内分泌紊乱密切相关。
（二）生活方式因素
长期的不良生活方式，如长期熬夜、过度节食、精神压力过大等，可能影响内分泌系统的平衡，从而增加卵巢囊肿的发生风险。例如长期精神压力过大可导致下丘脑-垂体-卵巢轴功能紊乱，影响卵巢的正常排卵和激素分泌，增加囊肿形成的可能性，这种情况可见于各个年龄段有相应生活方式的人群。
（三）环境因素
长期接触某些环境污染物，如工业化学品等，可能对卵巢组织产生不良影响，增加卵巢囊肿的发生几率，这种情况在长期处于有污染工作环境或生活在污染区域的人群中可能更易出现。
