良性肿瘤与恶性肿瘤在生长速度、生长方式、组织学形态、对机体的影响、复发情况及特殊人群等方面存在差异，良性肿瘤生长缓慢、多膨胀性生长、细胞分化程度高、对机体影响较小且复发少，恶性肿瘤生长快、多浸润性生长、细胞分化程度低、对机体影响大且易复发和转移，不同特殊人群患不同性质肿瘤各有特点。
恶性肿瘤：生长速度往往较快，短期内可能明显增大。这是由于肿瘤细胞失去了正常的生长调控机制，能够不受限制地迅速增殖，如肺癌患者肺部的肿瘤可能在几个月内就显著增大，压迫周围组织。
生长方式
良性肿瘤：多呈膨胀性生长，像膨胀的气球一样挤压周围组织，但通常不侵犯周围组织。一般有完整的包膜，与周围组织分界清楚，易于推动。比如子宫平滑肌瘤，它在子宫肌层内生长，有包膜包裹，与子宫肌层界限清晰。
恶性肿瘤：常呈浸润性生长，肿瘤细胞像树根长入泥土一样侵入周围组织、器官，与周围组织分界不清，通常没有包膜或者包膜不完整。例如乳腺癌，癌细胞可以侵犯周围的乳腺组织、筋膜甚至胸壁肌肉等。
组织学形态
良性肿瘤：细胞分化程度高，与起源组织的正常细胞形态相似。细胞的异型性小，细胞核的大小、形态比较一致，一般不会出现核分裂象或者核分裂象很少。比如甲状腺腺瘤的细胞形态与正常甲状腺细胞相似，核分裂象罕见。
恶性肿瘤：细胞分化程度低，与起源组织的正常细胞形态差异较大。细胞异型性明显，细胞核大小、形态不一致，核分裂象多见，并且可以出现病理性核分裂象。例如肺癌组织中，癌细胞形态多样，大小不一，核分裂象易见。
对机体的影响
良性肿瘤：主要是局部压迫和阻塞作用，一般对机体影响较小，多在体表或重要器官周围时才会引起相应症状。比如颅内的良性肿瘤较小的时候可能没有明显症状，增大到一定程度才会压迫脑组织引起头痛、呕吐等症状。
恶性肿瘤：除了局部压迫和阻塞外，还能破坏组织、器官的结构和功能，还可能发生转移，对机体影响较大，晚期常出现消瘦、乏力、贫血、发热等全身症状。例如肝癌患者会出现肝功能严重受损、黄疸、腹水等，还可能通过血行转移到肺、骨等部位，导致相应器官功能障碍。
复发情况
良性肿瘤：手术切除后一般很少复发。因为其边界清楚，完整切除后不容易有残留的肿瘤细胞。例如皮肤的良性色素痣，完整切除后复发概率低。
恶性肿瘤：手术切除后容易复发，而且还可能发生转移。这是因为恶性肿瘤细胞具有侵袭性和转移性，即使手术看起来切除干净了，也可能有少量癌细胞残留或者通过血液、淋巴等途径转移到其他部位。例如胃癌术后容易复发，并可能转移至肝脏、肺部等。
特殊人群方面，儿童患良性肿瘤时，由于儿童处于生长发育阶段，良性肿瘤如果生长在重要部位也可能影响其正常生长发育，如颅内良性肿瘤可能影响儿童的神经系统发育；而儿童患恶性肿瘤时，病情进展往往更快，对身体的损害更严重，治疗也更复杂。老年人患良性肿瘤时，可能因为机体功能衰退，手术风险相对较高；老年人患恶性肿瘤时，往往合并多种基础疾病，治疗需要更加谨慎地权衡利弊，并且预后通常比年轻人差。女性和男性在肿瘤的发生发展上可能有一些差异，比如乳腺癌在女性中更常见，而某些男性生殖系统的恶性肿瘤有其自身特点，但这并不是绝对的区分标准，只是在考虑肿瘤区分时需要综合这些性别相关因素。有基础病史的人群，如有肝脏基础病的人患肝脏肿瘤时，需要更细致地鉴别良性和恶性，因为基础病可能会影响肿瘤的表现和诊断。
