男性尿路感染的原因包括病原体感染（如大肠埃希菌等细菌及支原体、衣原体感染）、尿路梗阻（前列腺增生、尿路结石阻碍尿液排出利于细菌繁殖）、机体免疫力低下（糖尿病、艾滋病等基础疾病及不良生活方式致免疫下降）、医源性因素（导尿操作及泌尿系统器械检查破坏黏膜或带入细菌引发感染）。
一、病原体感染
1.细菌感染
大肠埃希菌：是男性尿路感染最常见的病原菌，约占尿路感染病原菌的80%左右。大肠埃希菌可通过尿道逆行进入泌尿系统，男性如果存在尿道结构异常，如尿道狭窄等情况，更容易让大肠埃希菌定植。另外，不注意个人卫生，如不经常清洗外阴部，也会增加大肠埃希菌感染的风险。例如，有研究表明，长期不更换内裤、不清洗会阴部的男性，大肠埃希菌尿路感染的发生率明显高于注意个人卫生的男性。
变形杆菌、克雷伯菌等：这些细菌也可引起男性尿路感染。变形杆菌往往在尿路有结石等基础疾病时容易滋生，因为结石会破坏尿路黏膜的完整性，为细菌提供了附着和繁殖的场所。克雷伯菌则可能在男性机体免疫力下降时，如患有糖尿病且血糖控制不佳时，更容易侵入泌尿系统导致感染。
2.支原体、衣原体感染
支原体和衣原体引起的尿路感染在男性中也较为常见，主要通过性接触传播。如果男性有不洁性行为史，就容易感染支原体或衣原体，从而引发尿路感染。例如，有调查显示，在有不洁性行为的男性中，支原体或衣原体尿路感染的检出率明显高于无不洁性行为的男性群体。
二、尿路梗阻
1.前列腺增生
多见于中老年男性，随着年龄的增长，前列腺增生的发生率逐渐升高。增生的前列腺会压迫尿道，导致尿液排出受阻，尿液在膀胱内潴留，为细菌的生长繁殖提供了良好的环境。长期的尿液潴留还会引起膀胱内压力增高，尿液逆流至输尿管甚至肾盂，进一步加重感染的范围。据统计，50岁以上的男性中，约半数患有前列腺增生，其中相当一部分会合并尿路感染。
2.尿路结石
尿路结石会阻碍尿液的正常流动，使尿液在局部积聚。结石表面不光滑，容易损伤尿路黏膜，使细菌更容易附着并繁殖。例如，肾结石患者，结石在肾盂输尿管交界处等部位梗阻时，尿液排出不畅，细菌容易在局部滋生，引发肾盂肾炎等尿路感染。而且，结石引起的尿路梗阻还会影响肾脏的正常排泄功能，导致肾脏功能受损，进一步影响机体对感染的抵抗能力。
三、机体免疫力低下
1.基础疾病影响
糖尿病：糖尿病患者由于血糖水平升高，尿液中含糖量增加，这为细菌的生长提供了丰富的营养物质。同时，糖尿病会导致机体的免疫功能下降，白细胞的吞噬功能减弱，使机体难以有效抵御细菌的入侵。研究发现，糖尿病患者发生尿路感染的概率比非糖尿病患者高2-3倍。例如，血糖控制不佳的糖尿病男性患者，更容易反复出现尿路感染，且感染不易控制。
艾滋病：艾滋病患者由于免疫系统受到严重破坏，CD4+T淋巴细胞数量显著减少，机体的免疫防御功能几乎完全丧失，极易发生各种机会性感染，包括尿路感染。艾滋病男性患者一旦发生尿路感染，病情往往较为严重，且难以治愈，因为其自身的免疫功能无法有效对抗病原体。
2.其他因素
长期使用免疫抑制剂的男性，如接受器官移植后需要长期服用免疫抑制剂来防止排异反应的男性，由于免疫抑制剂抑制了机体的免疫功能，也容易发生尿路感染。此外，长期熬夜、过度劳累等不良生活方式也会使机体免疫力下降，增加尿路感染的发生风险。比如，一些经常熬夜加班的男性，身体处于疲劳状态，免疫功能受到影响，相比生活作息规律的男性，更容易患上尿路感染。
四、医源性因素
1.导尿操作
男性如果因病情需要进行导尿操作，导尿管会破坏尿道的黏膜屏障，为细菌进入泌尿系统打开了门户。导尿时间越长，发生尿路感染的概率越高。一般来说，留置导尿管1天，尿路感染的发生率约为5%，留置3天以上，尿路感染的发生率可高达90%以上。例如，因手术需要长期留置导尿管的男性患者，尿路感染几乎是不可避免的，而且容易引发肾盂肾炎等严重的泌尿系统感染。
2.泌尿系统器械检查
如膀胱镜检查等泌尿系统器械检查，在操作过程中可能会损伤尿路黏膜，同时器械本身如果消毒不彻底，就会将细菌带入泌尿系统，从而引起尿路感染。在进行膀胱镜检查前，如果没有严格按照无菌操作规范进行准备，就会增加男性发生尿路感染的风险。
