新型冠状病毒与流感病毒在病原体、临床症状、流行病学、诊断方法、治疗及预防方面存在差异。新型冠状病毒属β属冠状病毒，基因组为单股正链RNA，症状多样，人群普遍易感，诊断可通过核酸检测等，治疗主要对症支持，预防需接种疫苗等；流感病毒属正粘病毒科，分节段单股负链RNA，起病急，人群易感，诊断有抗原检测等，治疗包括隔离、对症及抗病毒，预防靠接种疫苗等。
流感病毒：属于正粘病毒科，分为甲、乙、丙、丁四型，其中甲型和乙型流感病毒常引起季节性流行。病毒颗粒呈球形或丝状，直径80-120nm，基因组为分节段的单股负链RNA，根据病毒表面的血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）蛋白抗原性的不同，甲型流感病毒又可进一步分为不同的亚型，如H1N1、H3N2等。
临床症状方面
新型冠状病毒：
大多数患者以发热、干咳、乏力为主要表现，部分患者可以鼻塞、流涕、咽痛、嗅觉味觉减退或丧失、结膜炎、肌痛和腹泻等为主要表现。重症患者多在发病一周后出现呼吸困难和（或）低氧血症，严重者可快速进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、难以纠正的代谢性酸中毒和出凝血功能障碍及多器官功能衰竭等。
不同年龄人群感染后的表现可能有差异，儿童患者临床表现相对较轻，部分儿童及新生儿病例症状可不典型，表现为呕吐、腹泻等消化道症状或仅表现为精神弱、呼吸急促；而老年人感染后发生重症的风险相对较高。
流感病毒：
起病急，主要症状为高热（体温可达39-40℃）、头痛、肌痛和全身不适，体温可达39-40℃，可有畏寒、寒战，多伴全身肌肉关节酸痛、乏力、食欲减退等全身症状，常有咽喉痛、干咳，可有鼻塞、流涕、胸骨后不适等。颜面潮红，眼结膜充血。部分以呕吐、腹痛、腹泻为特点，常见于儿童。
儿童感染流感后出现喉炎、气管炎、支气管炎、毛细支气管炎、肺炎及胃肠道症状较成人常见；老年人感染流感后则更易出现肺炎、心力衰竭、呼吸衰竭等并发症，预后相对较差。
流行病学方面
新型冠状病毒：人群普遍易感，主要通过呼吸道飞沫和密切接触传播，在相对封闭的环境中经气溶胶传播，接触被病毒污染的物品也可造成感染。潜伏期1-14天，多为3-7天。
流感病毒：人群普遍易感，流感患者和隐性感染者是主要传染源，自发病后1-7天均可从鼻涕、口涎、痰液等分泌物排出病毒，传染期约1周，以病初2-3天传染性最强。主要通过空气中的飞沫、人与人之间的接触或与被污染物品的接触传播。
诊断方法方面
新型冠状病毒：
实时荧光RT-PCR检测鼻咽拭子、痰和其他下呼吸道分泌物、血液、粪便等标本中的新型冠状病毒核酸是常用的诊断方法，一般发病1周内的患者核酸阳性率较高。
病毒基因测序，如与已知的新型冠状病毒序列高度同源，也可明确诊断。
血清学检测，如特异性IgM抗体和IgG抗体在感染后期会呈阳性，且恢复期抗体水平较急性期有4倍及以上升高，也有助于诊断，但需结合流行病学史等综合判断。
流感病毒：
流感病毒抗原检测，常用免疫荧光法等，可快速检测标本中的流感病毒抗原，有助于早期诊断，但敏感性低于核酸检测。
实时荧光RT-PCR检测呼吸道标本（如鼻咽拭子、咽拭子、鼻腔吸取物、痰）中的流感病毒核酸，能快速明确是否为流感病毒感染及具体的型别和亚型。
血清学检测，发病初期和恢复期双份血清的流感病毒特异性IgG抗体水平呈4倍或以上升高，有助于回顾性诊断。
治疗方面
新型冠状病毒：目前主要是对症支持治疗，同时针对病情严重程度采取相应的治疗措施，如氧疗、抗病毒治疗（如奈玛特韦/利托那韦片组合包装等，但需严格掌握适应证）等。对于轻型病例实行集中隔离管理，通常不需要特殊治疗，加强对症支持治疗，密切观察病情变化；普通型、重型、危重型病例和有重症高危因素的病例应在定点医院集中治疗。
流感病毒：
隔离：流感患者应居家隔离，避免传播他人。
对症治疗：高热者可进行物理降温或应用解热药物，如对乙酰氨基酚等；咳嗽咳痰严重者可给予止咳祛痰药物，如氨溴索等。
抗病毒治疗：发病48小时内进行抗病毒治疗可减少并发症、降低病死率、缩短住院时间，常用药物有奥司他韦、扎那米韦等，需在医生指导下使用。
预防方面
新型冠状病毒：
接种新型冠状病毒疫苗是预防新型冠状病毒感染及其重症的有效手段，符合接种条件的人群应积极接种。
日常要做好个人防护，如佩戴口罩（尤其是在密闭场所、人员密集场所）、勤洗手、保持社交距离等；注意室内通风换气等。
老年人、慢性基础疾病患者、免疫力低下人群等更应加强防护，尽量减少前往人员密集场所，如必须前往需严格做好防护措施。
流感病毒：
接种流感疫苗是预防流感最有效的手段。
保持良好的个人卫生习惯，如勤洗手，避免用手触摸眼睛、鼻或口；在流感流行季节，尽量避免去人群聚集场所，如必须前往可佩戴口罩；咳嗽或打喷嚏时用纸巾、毛巾等遮住口鼻，然后妥善丢弃纸巾，接触呼吸道分泌物后彻底洗手等。
加强身体锻炼，增强体质，保持充足睡眠和合理营养，提高身体免疫力。
