碘酊对跖疣有一定辅助效果，但无法根除病毒，需结合其他治疗方式。
跖疣由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，病毒导致足底皮肤细胞异常增生形成疣体。碘酊作为消毒剂，通过氧化作用破坏微生物蛋白结构，可杀灭疣体表面的细菌等微生物，减少继发感染风险，且其腐蚀性可能使疣体组织蛋白变性坏死，促使疣体脱落。然而，碘酊无法直接灭活HPV病毒，仅依赖碘酊治疗难以彻底清除病毒，易导致跖疣复发。
对于较小、症状较轻的跖疣，碘酊可能改善症状；但对于较大、数量较多或病程较长的跖疣，单纯使用碘酊效果有限。临床常采用冷冻治疗、激光治疗等物理方法去除疣体后，再配合碘酊防止感染，同时可能使用免疫调节剂增强机体对病毒的抵抗力，以提高治愈率并降低复发率。
