跖疣冷冻治疗后通常可以治好，但存在一定复发率，临床治愈率可达70%-80%。
冷冻治疗通过液氮（-196℃）直接作用于疣体，使细胞快速冷冻形成冰晶，破坏细胞结构导致坏死脱落，同时刺激局部免疫反应清除残留病毒。多数患者经2-4次治疗（间隔2-3周）可完全清除疣体，尤其适用于直径小于5毫米的孤立性跖疣。
然而，治疗效果存在个体差异。疣体较大、位置较深或免疫力较低的患者，可能因病毒潜伏感染、治疗深度不足或免疫抑制状态导致复发，复发率约10%-20%。此外，冷冻治疗可能引起疼痛、水疱、结痂及局部色素沉着或减退，通常1-2周内消退。治疗期间需保持创面干燥清洁，避免搔抓，穿着透气鞋袜减少摩擦，可涂抹莫匹罗星软膏预防感染。若3个月内无复发迹象，可视为临床治愈。
