真菌感染和疣有致病原因不同、症状表现不同、好发部位不同、治疗方式不同等。
1.致病原因不同
真菌感染由真菌（如皮肤癣菌、念珠菌）引起，真菌可在温暖潮湿环境中繁殖，侵犯皮肤、毛发或指甲；疣则由人乳头瘤病毒（HPV）感染导致，病毒通过皮肤微小破损侵入，刺激表皮细胞异常增殖形成赘生物，两者致病微生物完全不同。
2.症状表现不同
真菌感染常表现为皮肤红斑、脱屑、瘙痒，如脚气（足癣）有水疱、糜烂，灰指甲（甲癣）会使指甲变厚、变色、变脆；疣多为粗糙凸起的赘生物，表面呈乳头状或菜花状，如跖疣（足底）、寻常疣（手部），通常无明显瘙痒，按压可能疼痛。
3.好发部位不同
真菌感染好发于潮湿多汗部位，如足部、腹股沟、腋窝、指甲缝，因这些部位易滋生真菌；疣可发生在全身各处，常见于手部、足底、面部、颈部，多因这些部位易接触病毒且易出现皮肤破损，HPV更易侵入。
4.治疗方式不同
真菌感染需用抗真菌药物，如外用酮康唑乳膏、口服伊曲康唑，通过抑制真菌生长清除感染；疣需针对HPV治疗，如外用咪喹莫特乳膏、进行冷冻/激光治疗，或口服免疫调节剂增强免疫力，帮助清除病毒，两者用药和治疗逻辑差异显著。
