流感病毒和冠状病毒是不同的病毒，在病毒分类与基因结构、流行病学特点、临床症状表现、诊断与检测方法等方面均有区别，预防、诊断和治疗需依各自特点进行，不同人群面对两者感染时的预防和关注重点也不同。
病毒形态与结构蛋白：流感病毒呈多形性，一般为球形，直径80-120nm，病毒颗粒表面有两种重要的糖蛋白刺突，即血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）；冠状病毒形态上类似日冕，有明显的棒状粒子向外突出，形如王冠，其表面的刺突蛋白是S蛋白，S蛋白对于病毒识别宿主细胞受体等过程起关键作用，二者在形态和结构蛋白组成上有显著差异。
流行病学特点不同
流感病毒：流感病毒分为甲、乙、丙、丁四型，其中甲型流感病毒易发生变异，可引起世界性大流行，人群普遍易感，在冬春季等季节高发，传播途径主要是经飞沫传播，也可通过接触被病毒污染的物品传播。例如历史上1918年的西班牙大流感就是由甲型流感病毒引起的全球大流行，致死人数众多。
冠状病毒：冠状病毒有多种型别，像引发非典型肺炎的SARS冠状病毒、引发中东呼吸综合征的MERS冠状病毒以及引发新冠肺炎的新冠病毒（SARS-CoV-2）等。不同型别的冠状病毒传播特点有所差异，新冠病毒主要通过飞沫传播和接触传播，在人群普遍易感，全球大流行期间各年龄段人群均可发病，不过老年人等有基础疾病的人群感染后重症风险相对较高，其流行季节相对不局限于特定季节，在不同气候条件下均可传播。
临床症状表现有别
流感病毒：感染流感病毒后，潜伏期通常1-4天，起病多较急，主要症状为高热（体温可达39-40℃）、头痛、肌痛、全身不适等全身症状明显，呼吸道症状相对较轻，如可有咳嗽、流涕、咽痛等，但部分患者也可出现较为严重的肺炎等下呼吸道感染表现，儿童感染流感后可能出现呕吐、腹泻等胃肠道症状，年幼儿童还可能出现高热惊厥等情况。
冠状病毒：以新冠病毒为例，潜伏期1-14天，多为3-7天，感染后症状多样，多数患者表现为发热、干咳、乏力，部分患者可伴有鼻塞、流涕、咽痛、嗅觉味觉减退或丧失、结膜炎、肌痛和腹泻等症状，重症患者多在发病一周后出现呼吸困难和（或）低氧血症，严重者可快速进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、难以纠正的代谢性酸中毒和出凝血功能障碍及多器官功能衰竭等，儿童感染新冠病毒后的症状相对成人可能更不典型，有的可能仅表现为发热伴呼吸道症状较轻，也有部分儿童会出现川崎病样表现等特殊情况。
诊断与检测方法差异
流感病毒：可通过实时荧光RT-PCR检测病毒核酸，这是常用的确诊方法，也可采用免疫荧光法检测呼吸道标本中的流感病毒抗原等进行辅助诊断，例如采集鼻咽拭子等标本进行检测，能快速明确是否为流感病毒感染及具体型别等。
冠状病毒：对于新冠病毒等冠状病毒的诊断，同样可采用实时荧光RT-PCR检测病毒核酸，还可进行病毒基因测序等，另外血清学检测如检测特异性IgM和IgG抗体等也可作为诊断的辅助依据，通过多种检测手段综合判断是否为冠状病毒感染及相关情况。
总之，流感病毒和冠状病毒是不同的病毒，在多个方面存在明显区别，在预防、诊断和治疗等方面都需要依据其各自特点进行相应处理。对于不同人群，如儿童、老年人等，在面对这两种病毒感染时，预防措施和关注重点等也有所不同，例如儿童由于免疫系统发育不完善，在流感和冠状病毒感染预防中更需注重个人卫生、避免去人群密集场所等，老年人有基础疾病时感染后更要密切监测病情变化等。
