沙眼衣原体感染男女症状有别，女性可致宫颈炎（多数无症状，有症状者阴道分泌物异常、性交后出血等）、尿道炎（尿频、尿急、尿痛等）、盆腔炎（下腹痛、发热、月经紊乱等）；男性有尿道炎（尿道刺痒、尿痛、分泌物稀薄等）、附睾炎（附睾肿大疼痛、阴囊皮肤红肿等），既往有相关病史者感染后更易复发加重。
一、女性沙眼衣原体感染症状
1.宫颈炎相关症状
多数女性感染沙眼衣原体后无明显症状，有症状者主要表现为宫颈炎相关表现。患者可能出现阴道分泌物增多，分泌物性质可为黏液脓性，颜色可能发黄等。同时，可伴有性交后出血等情况。从发病机制来看，沙眼衣原体感染宫颈上皮细胞，引起炎症反应，导致宫颈局部的病理改变，进而出现上述分泌物及接触性出血等表现。
对于不同年龄的女性，青春期女性由于生殖系统尚在发育中，感染沙眼衣原体后宫颈炎症状可能相对不典型，但同样可能出现阴道分泌物异常等情况；育龄期女性则更易出现与妊娠等相关的问题，若在妊娠期间感染，可能增加早产等风险；围绝经期女性由于激素水平变化，生殖道局部抵抗力下降，感染后症状可能相对更易被忽视，但同样存在宫颈炎相关症状的可能。
2.尿道炎相关症状
部分女性感染沙眼衣原体可同时合并尿道炎，出现尿频、尿急、尿痛等膀胱刺激症状。这是因为沙眼衣原体感染尿道黏膜，引起尿道炎症，导致尿道的敏感性增加，出现排尿时的不适症状。例如，患者会感觉排尿次数频繁，每次尿量少，排尿时尿道有灼热样疼痛等。
不同生活方式的女性，如长期久坐、卫生习惯不良的女性，感染沙眼衣原体后尿道炎症状可能更易出现且相对更明显。因为久坐会导致会阴部局部不透气，有利于沙眼衣原体的繁殖，而不良卫生习惯会增加病原体感染尿道的机会。
3.盆腔炎相关症状
若沙眼衣原体感染未及时治疗，可上行引起盆腔炎。患者可出现下腹部疼痛，疼痛可为持续性，在活动或性交后加重。还可能伴有发热，体温可不同程度升高，一般为低热到中度发热。部分患者还可能出现月经紊乱等情况，如月经周期延长、月经量增多或减少等。盆腔炎的发生是沙眼衣原体感染通过宫颈管等途径蔓延至盆腔，引起盆腔内的炎症反应，累及多个生殖器官周围组织。
有既往盆腔炎病史的女性，再次感染沙眼衣原体后更易发生盆腔炎复发或加重。因为其盆腔局部的组织已经存在一定的病理基础，沙眼衣原体的感染更容易引发炎症的扩散和加重。
二、男性沙眼衣原体感染症状
1.尿道炎症状
男性感染沙眼衣原体后，常见的症状是尿道炎相关表现。起病相对较缓慢，初期可能有尿道刺痒感，随后出现尿痛，疼痛程度一般为轻到中度。尿道分泌物一般为稀薄浆液性或黏液脓性，量相对较少。发病机制是沙眼衣原体侵入尿道上皮细胞，引起尿道的炎症反应，导致尿道黏膜的充血、水肿等改变，从而出现上述刺痒、尿痛及分泌物等症状。
不同年龄的男性，青春期男性由于生殖系统发育，感染后尿道炎症状可能与成年人有所不同，但总体表现类似；中年男性若有不良生活方式，如长期饮酒、熬夜等，会降低机体抵抗力，感染沙眼衣原体后尿道炎症状可能更易迁延不愈；老年男性由于前列腺等问题，感染后症状可能不典型，但仍可能出现尿道不适等情况。
2.附睾炎相关症状
部分男性沙眼衣原体感染可引起附睾炎，表现为附睾肿大、疼痛，疼痛可放射至阴囊、腹股沟等部位。触摸附睾时可有明显的触痛，严重时阴囊皮肤可出现红肿等表现。这是因为沙眼衣原体感染通过尿道蔓延至附睾，引起附睾的炎症反应，导致附睾组织的充血、水肿及炎性细胞浸润等病理改变。
有附睾炎既往史的男性，再次感染沙眼衣原体后发生附睾炎复发的风险较高。因为其附睾局部的组织已经存在一定的病理损伤，沙眼衣原体的感染更容易引发炎症的复发和加重。
