胚胎停止发育的原因包括染色体因素（胚胎自身染色体异常常见）、母体因素（内分泌、生殖器官、感染等方面异常影响）、免疫因素（自身免疫性疾病及同种免疫异常）、环境因素（化学物质接触、辐射暴露）、父亲因素（精子质量问题致染色体异常）。
一、染色体因素
胚胎自身染色体异常：胚胎染色体数目或结构异常是导致胚胎停止发育最常见的原因之一。在自然流产的胚胎中，约50%-60%存在染色体异常。例如，常见的染色体数目异常包括三体、单体等，结构异常包括染色体易位、缺失等。这种情况与胚胎自身的遗传物质有关，是胚胎在发育早期就出现的问题，与父母的年龄、生活环境等因素可能有一定关联，年龄较大的父母，其生殖细胞发生染色体畸变的概率增加，从而导致胚胎染色体异常的风险升高。
二、母体因素
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对于维持子宫内膜容受性和妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的子宫环境，就可能导致胚胎停止发育。研究表明，黄体功能不全的女性发生胚胎停止发育的风险比正常女性高。例如，血清孕酮水平低于一定数值时，胚胎停止发育的可能性增大。
甲状腺功能异常：甲状腺激素对胚胎的生长发育起着重要的调节作用。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，会影响胚胎的代谢和发育过程，增加胚胎停止发育的风险；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也可能干扰胚胎的正常发育。例如，临床发现甲状腺功能异常的孕妇，胚胎停止发育的发生率较甲状腺功能正常的孕妇明显升高。
生殖器官异常
子宫解剖结构异常：如子宫畸形，包括纵隔子宫、双角子宫等，子宫的形态异常会影响胚胎的着床和发育空间。宫腔粘连也会破坏子宫内膜的正常结构和功能，不利于胚胎的种植和生长，从而增加胚胎停止发育的风险。例如，有纵隔子宫的女性妊娠后，胚胎停止发育的概率相对较高。
子宫肌瘤：较大的子宫肌瘤可能会影响子宫的血液循环，压迫胚胎着床部位，或者改变宫腔内环境，导致胚胎停止发育。尤其是黏膜下子宫肌瘤，对胚胎的影响更为明显。
感染因素
TORCH感染：包括弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。孕妇在孕期感染这些病原体后，病原体可通过胎盘感染胚胎，影响胚胎的正常发育，导致胚胎停止发育。例如，孕妇感染风疹病毒后，胎儿发生流产、死胎或先天性畸形的风险显著增加。
其他感染：如细菌感染引起的子宫内膜炎等，炎症会破坏子宫内膜的环境，影响胚胎的着床和发育，从而可能导致胚胎停止发育。
三、免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击胚胎，影响胚胎的正常发育，导致胚胎停止发育。自身免疫性疾病产生的自身抗体可以通过多种途径影响胎盘的血液循环和免疫调节，进而干扰胚胎的生长。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫排斥反应异常也可能导致胚胎停止发育。例如，母胎免疫耐受机制失调，母体免疫系统将胚胎视为外来物进行攻击，从而破坏胚胎的正常发育。
四、环境因素
化学物质接触：孕妇接触过多的有害化学物质，如苯、甲醛、农药等，这些化学物质可能通过胎盘进入胚胎体内，干扰胚胎的正常细胞分裂和分化过程，导致胚胎停止发育。例如，长期处于含有高浓度化学污染物环境中的孕妇，胚胎停止发育的风险增加。
辐射暴露：孕妇受到过量的辐射，如X射线、放射性物质等，辐射可能导致胚胎细胞的DNA损伤，影响胚胎的发育，增加胚胎停止发育的可能性。例如，在放射科工作的孕妇，如果没有做好防护措施，胚胎受到辐射的风险较高。
五、父亲因素
精子质量问题：父亲的精子染色体异常也可能导致胚胎停止发育。精子的染色体畸变率增加，会使受精卵的遗传物质出现异常，从而影响胚胎的正常发育。例如，长期吸烟、酗酒、接触有害物质的男性，其精子质量可能下降，染色体异常的概率增加，进而增加胚胎停止发育的风险。
