自然流产受多种因素影响，包括遗传因素（如染色体异常，尤其胚胎染色体数目异常常见，孕妇年龄增大致染色体异常概率升高）、解剖因素（子宫畸形如单角、双角、纵隔子宫及宫腔粘连等影响胚胎着床发育）、内分泌因素（黄体功能不全致孕酮不足，甲状腺功能异常干扰妊娠）、感染因素（生殖道细菌如支衣原体，病毒如风疹、巨细胞、单纯疱疹病毒感染影响胚胎）、免疫因素（自身免疫性疾病致自身抗体攻击胚胎，同种免疫异常致母体攻击胚胎）、环境因素（长期接触化学物质如铅汞苯，过多接触放射线等物理因素损害胚胎）。
解剖因素
子宫解剖结构异常：
子宫畸形：如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等。子宫畸形会使子宫腔形态异常，影响胚胎的着床和发育环境。例如，纵隔子宫会导致宫腔容积减小，胚胎种植空间受限，从而增加自然流产的风险。这种情况在有子宫畸形病史的人群中较为突出，且与子宫畸形的类型和严重程度相关，严重的子宫畸形往往会有更高的自然流产发生率。
宫腔粘连：多由于宫腔操作（如人工流产、刮宫等）、感染等原因引起。宫腔粘连会破坏子宫内膜的完整性和功能，影响胚胎的着床和营养供应，进而导致自然流产。有宫腔操作史的女性发生宫腔粘连的风险增加，从而使自然流产的可能性增大。
内分泌因素
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对于维持妊娠至关重要。黄体功能不全时，孕酮分泌不足，不能满足胚胎着床和发育的需求，容易导致流产。多见于有内分泌疾病史、多次流产史的女性。一般通过检测孕激素水平等进行评估，黄体功能不全的女性在孕期需要密切监测孕激素情况。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都可能影响妊娠。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的生长发育，增加自然流产的风险；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰妊娠过程。患有甲状腺疾病的女性在计划妊娠或已经妊娠时，需要积极控制甲状腺功能，使其维持在正常范围内，以降低自然流产的发生风险。
感染因素
生殖道感染：
细菌感染：如支原体、衣原体感染等。这些病原体可通过影响子宫内膜的环境，导致炎症反应，进而影响胚胎的着床和发育。孕妇如果在孕期发生生殖道细菌感染，尤其是上行感染至宫腔，容易引发自然流产。有不洁性生活史、多次流产史的女性感染风险相对较高。
病毒感染：如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。孕期感染病毒可通过胎盘影响胚胎，导致胚胎发育异常，引起自然流产。在风疹流行季节，未接种风疹疫苗的孕妇感染风疹病毒的风险增加，从而可能导致自然流产。
免疫因素
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮等。自身免疫性疾病患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击胚胎，影响妊娠的正常进行。患有自身免疫性疾病的孕妇需要在医生的指导下进行规范的治疗和管理，控制自身免疫反应，以降低自然流产的发生几率。
同种免疫异常：母体对胚胎的免疫耐受异常，导致母体免疫系统攻击胚胎。这种情况在反复自然流产的女性中较为常见，需要通过相关免疫检查进行评估，必要时采取相应的免疫治疗措施。
环境因素
化学物质接触：长期接触某些化学物质，如铅、汞、苯等，可能影响胚胎的发育，增加自然流产的风险。例如，从事化工行业、长期接触染发剂等含有化学物质产品的女性，在妊娠期间需要尽量避免接触这些有害物质，以减少自然流产的发生可能。
物理因素：过多接触放射线等物理因素也可能对胚胎造成损害，导致自然流产。在工作或生活中经常接触放射线的人群，如放射科工作人员等，在备孕和妊娠期间需要采取严格的防护措施，避免接触过多放射线。
