新生儿黄疸病因分为生理性和病理性两类。生理性黄疸因胆红素生成相对多、肝细胞摄取和结合胆红素能力不足、肠肝循环增加所致；病理性黄疸包括胆红素生成过多（红细胞增多症、血管外溶血等）、肝脏胆红素代谢障碍（缺氧感染、相关综合征、药物等）、胆汁排泄障碍（新生儿肝炎、先天性胆道闭锁、遗传性代谢性疾病等）。
一、生理性黄疸病因
胆红素生成相对较多：新生儿红细胞数量相对较多且寿命较短，血红蛋白分解产生的胆红素量较多，而成人每天每千克体重生成胆红素约8.8mg，新生儿则可达14mg/kg，导致胆红素产生过多。
肝细胞摄取胆红素能力不足：新生儿肝脏内Y、Z蛋白含量低，出生后5-10天才达到成人水平，使得肝细胞摄取胆红素的能力受限，影响胆红素的摄取过程。
肝细胞结合胆红素能力不足：UDP-GT（尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶）活性低下且受诱导不足，生后1周内仅为成人的1%-2%，约于生后1个月接近成人水平，从而影响胆红素与葡萄糖醛酸结合形成结合胆红素的过程。
肠肝循环增加：新生儿肠道内正常菌群尚未完全建立，β-葡萄糖醛酸苷酶活性较高，可将结合胆红素水解成未结合胆红素，加之肠道内缺乏细菌，导致结合胆红素的排泄减少，使得未结合胆红素经肠肝循环重吸收增加。
二、病理性黄疸病因
胆红素生成过多
红细胞增多症：常见于母-胎或胎-胎间输血、脐带结扎延迟等情况，使红细胞数量增多，破坏增加，胆红素生成过多。例如，当胎儿-母亲之间发生输血时，可导致胎儿红细胞增多，出生后红细胞破坏释放出大量胆红素。
血管外溶血：如头颅血肿、皮下血肿、颅内出血等，红细胞破坏，胆红素产生增加。比如头颅血肿，局部的红细胞破裂，血红蛋白释放，进而代谢产生胆红素。
同族免疫性溶血：多见于ABO血型不合或Rh血型不合等。ABO血型不合中，母亲多为O型血，胎儿为A型或B型血，母亲体内存在的抗A或抗B抗体通过胎盘进入胎儿体内，引起胎儿红细胞破坏；Rh血型不合时，母亲Rh阴性，胎儿Rh阳性，母亲被胎儿Rh阳性红细胞致敏后产生抗体，抗体通过胎盘进入胎儿体内导致溶血。
感染：细菌、病毒、螺旋体等感染可导致红细胞破坏增加。例如，新生儿败血症时，细菌产生的毒素等可破坏红细胞，使胆红素生成增多。
肠肝循环增加：先天性肠道闭锁、先天性幽门肥厚、巨结肠等肠道疾病可使胎便排出延迟，导致胆红素重吸收增加；母乳性黄疸可能与母乳中的某些物质抑制了UDP-GT活性或促进了肠肝循环有关。
肝脏胆红素代谢障碍
缺氧和感染：可影响肝细胞对胆红素的摄取和结合能力。如新生儿窒息、肺炎等情况，缺氧和感染导致肝细胞功能受影响，从而影响胆红素的代谢。
Crigler-Najjar综合征：是一种先天性UDP-GT缺乏症，分为Ⅰ型和Ⅱ型，Ⅰ型为完全缺乏，Ⅱ型为部分缺乏，导致结合胆红素生成障碍。
Gilbert综合征：是一种先天性非溶血性黄疸，为UDP-GT活性降低所致，属于常染色体显性遗传。
Lucey-Driscoll综合征：又称暂时性家族性新生儿黄疸，由于妊娠后期孕妇血清中存在一种抑制UDP-GT的物质，导致新生儿出现黄疸，分娩后黄疸可自行消退。
药物：某些药物如磺胺、水杨酸盐等可与胆红素竞争Y、Z蛋白的结合位点，影响胆红素的摄取；新生霉素可抑制UDP-GT活性，从而影响胆红素的结合。
胆汁排泄障碍
新生儿肝炎：多由病毒引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等，病毒感染导致肝细胞受损，胆汁排泄障碍，胆红素在体内积聚。
先天性胆道闭锁：可分为肝内型和肝外型，肝外型较多见，是由于胆道发育异常，导致胆汁排泄受阻，胆红素反流入血，引起黄疸。
遗传性代谢性疾病：如α1-抗胰蛋白酶缺乏症、半乳糖血症等，可影响胆汁的排泄或胆红素的代谢过程，导致黄疸。
