新生儿疾病多数能医治，具体预后取决于疾病类型、严重程度、治疗及时性及医疗条件。
新生儿因器官发育不成熟，易患感染性疾病、代谢性疾病、先天性疾病等。随着新生儿医疗技术发展，多数疾病可通过早期诊断和治疗控制，如新生儿黄疸通过光疗、换血治疗可有效降低胆红素水平，避免核黄疸发生；细菌感染使用敏感抗生素治疗，治愈率较高；先天性心脏病中，简单畸形（如室间隔缺损）可通过手术根治，复杂畸形也可通过分期手术改善心功能。
但对于极重度早产儿并发症（如超早早产儿的呼吸窘迫综合征合并多器官衰竭）、罕见遗传性疾病（如某些致死性代谢病），治疗难度大，预后可能较差。
关键在于新生儿出现异常症状时及时就医，通过新生儿重症监护、专科治疗，最大限度提高治愈率和生存质量。
