自然流产的原因包括胚胎因素（染色体异常、基因异常）、母体因素（全身性疾病、生殖器官异常、不良生活方式）、父亲因素（精子染色体异常）、环境因素（化学物质接触、物理因素）。胚胎因素中染色体或基因异常致胚胎发育异常；母体因素里全身性疾病如感染、内分泌异常等，生殖器官异常如子宫畸形等，不良生活方式如吸烟饮酒等均会影响；父亲精子染色体异常可致胚胎染色体问题；环境中化学物质、放射线等会增加流产风险。
一、胚胎因素
1.染色体异常
染色体异常是早期自然流产最常见的原因。无论是数目异常还是结构异常都可能导致胚胎发育异常。例如，常见的三体综合征，如13-三体、18-三体、21-三体等，都会使胚胎无法正常发育，从而引发自然流产。这种情况在年龄较大的孕妇中相对更易发生，因为随着女性年龄的增长，卵子质量下降，染色体发生异常的概率增加。
2.基因异常
一些单基因的缺陷也可能导致胚胎发育障碍进而引起自然流产。比如某些与胚胎发育关键过程相关的基因发生突变，会影响胚胎的正常分化、组织器官形成等过程，最终导致流产发生。
二、母体因素
1.全身性疾病
感染：孕妇感染某些病原体，如细菌（如李斯特菌等）、病毒（如风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等）、原虫（如弓形虫等）。这些病原体可以通过胎盘感染胚胎，影响胚胎的正常发育，引发流产。例如，孕妇在早孕期感染风疹病毒，可能导致胎儿先天性白内障、心脏病、耳聋等多种畸形，进而引起流产。
内分泌异常
黄体功能不全：黄体分泌的孕酮对维持妊娠至关重要。如果黄体功能不全，孕酮分泌不足，就不能为胚胎着床和发育提供良好的子宫内环境，从而增加自然流产的风险。研究表明，约30%-40%的早期流产与黄体功能不全有关。
甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都可能影响妊娠。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，会导致代谢率降低，影响胚胎的生长发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰妊娠过程，增加流产的发生几率。
免疫功能异常
自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮等，患者体内存在自身抗体，这些抗体可能攻击胚胎组织，导致流产。另外，母胎免疫耐受失衡也可能引发流产，正常妊娠时母体对胚胎处于一种免疫耐受状态，若这种耐受被打破，母体免疫系统对胚胎产生免疫排斥反应，就会导致流产。
其他：孕妇患有严重的贫血、慢性肾炎、高血压等全身性疾病，会使胎盘供血不足，影响胚胎的营养供应，从而增加自然流产的风险。
2.生殖器官异常
子宫解剖结构异常：如子宫畸形，包括纵隔子宫、双角子宫等，子宫的形态异常会影响胚胎的着床和发育空间，导致流产。宫腔粘连也会影响胚胎的种植和生长，因为粘连会使宫腔容积减小，内膜受损，不利于胚胎的正常发育。
宫颈机能不全：多见于中晚期妊娠，但也有部分患者在早期妊娠就出现宫颈口扩张，导致流产。宫颈机能不全的孕妇，宫颈不能维持妊娠所需的张力，随着妊娠进展，宫颈口逐渐扩张，最终引发流产。
3.不良生活方式
吸烟饮酒：孕妇吸烟会使尼古丁等有害物质进入体内，影响胎盘的血液循环，导致胎儿缺氧、发育受限，增加流产的风险。饮酒则可能通过影响胚胎的细胞分裂、器官形成等过程，引发自然流产。研究发现，孕妇每天吸烟10支以上，流产的发生率明显高于不吸烟的孕妇；过量饮酒（每周饮酒量超过一定限度）也会显著增加流产的可能性。
过度劳累及精神压力过大：长期的过度劳累会使孕妇身体处于应激状态，影响内分泌平衡和机体的免疫功能等，从而增加自然流产的风险。精神压力过大时，体内会分泌过多的应激激素，干扰妊娠相关的内分泌调节，导致流产几率上升。
三、父亲因素
父亲的精子染色体异常也可能导致胚胎染色体异常，从而引发自然流产。例如，父亲的精子发生染色体结构或数目异常，与卵子结合后形成的胚胎就可能存在染色体问题，进而导致流产发生。
四、环境因素
1.化学物质接触
孕妇接触某些有害化学物质，如苯、甲醛、铅等。这些化学物质可以通过呼吸道、皮肤等途径进入母体，影响胚胎的发育，增加自然流产的风险。例如，在一些化工环境中工作的孕妇，长期接触有害化学物质，流产的发生率会明显高于普通人群。
2.物理因素
过多接触放射线，如孕妇在不知情的情况下接受了X线检查等，放射线会对胚胎的细胞造成损伤，影响胚胎的正常发育，导致流产。此外，高温环境也可能对胚胎产生不良影响，例如长期处于高温工作环境或频繁洗热水澡等，可能干扰胚胎的生长环境，增加流产风险。
