尖锐湿疣很难彻底根治，但可通过规范治疗改善临床症状，比如冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗、药物治疗等。
1.冷冻治疗
利用低温使疣体组织坏死脱落。通过液氮等制冷剂作用于疣体，适用于单发或少量多发的尖锐湿疣，对于女性阴道内等部位的疣体也可尝试，但操作需精准，避免损伤周围正常组织。一般来说，多次治疗可能需要进行，免疫功能正常的患者经合适次数冷冻治疗后部分可达到临床治愈，但免疫低下者可能复发风险高。
2.激光治疗
用激光的高能量烧灼疣体，使其碳化、脱落。可快速去除可见疣体，对于较小的疣体效果较好，但可能会有疼痛、留下瘢痕等风险，尤其是面部等特殊部位治疗时需谨慎。不同个体恢复时间不同，免疫功能正常者恢复相对较快，免疫低下者恢复慢且易复发。
3.电灼治疗
用高频电流烧灼疣体，原理与激光类似。能直接破坏疣体组织，对于较大的疣体可选用，但操作不当可能导致出血过多或损伤周围组织，术后需注意预防感染，免疫状态影响恢复及复发情况。
4.药物治疗
鬼臼毒素酊通过抑制细胞有丝分裂，使其坏死脱落，适用于治疗直径≤10mm的外生殖器和肛周尖锐湿疣；咪喹莫特乳膏是一种免疫调节剂，通过刺激局部干扰素等细胞因子的产生发挥作用，这些药物应遵医嘱使用。
