生化妊娠可能是胚胎染色体异常、母体激素水平异常、子宫环境不佳、外界因素干扰等原因引起的。
1.胚胎染色体异常
这是生化妊娠最常见的原因，如果精子或卵子携带的染色体数目或结构异常，形成的受精卵染色体异常，无法正常着床和发育，会自然淘汰，表现为生化妊娠。这种情况多为偶然发生，是机体自然选择的结果。
2.母体激素水平异常
母体孕酮水平过低，无法支持子宫内膜正常增厚和胚胎着床，易导致生化妊娠；甲状腺功能异常，如甲状腺功能减退，会影响激素分泌和新陈代谢，干扰胚胎发育环境，增加生化妊娠的发生几率，需通过激素检查明确情况。
3.子宫环境不佳
子宫内膜薄、子宫内膜息肉、宫腔粘连等子宫病变，会影响子宫内膜的容受性，使受精卵无法顺利着床，从而引发生化妊娠。此外，子宫畸形，如纵隔子宫，也可能影响胚胎发育，导致生化妊娠。
4.外界因素干扰
备孕或受孕早期，女性如果长期接触放射性物质、化学毒物，如甲醛、农药等，或长期处于精神紧张、焦虑、压力过大的状态，以及过度劳累、熬夜、吸烟饮酒等，都可能影响胚胎着床和发育，诱发生化妊娠。
