九价HPV疫苗有十类禁忌情况，分别是对疫苗成分过敏者绝对不能接种；发热期人群接种可能影响免疫效果等；妊娠期女性因安全性数据不充分不建议接种；免疫功能低下者接种难产生有效抗体；正在患急性严重疾病者接种可能干扰应对；已感染高危型HPV者接种对已感染型别无效；过去接种有严重不良反应者再次接种风险高不宜接种；哺乳期女性需谨慎评估；严重神经系统疾病未控制者接种可能加重症状；对HPV疫苗接种程序有特殊禁忌情况也不能接种，因规范程序保障免疫效果。
一、对九价HPV疫苗成分过敏者
若既往明确对九价HPV疫苗中的任何成分，如酵母、蛋白质等发生过严重过敏反应，包括过敏性休克、严重皮疹等，此类人群绝对不能接种九价疫苗，因为过敏反应可能危及生命，有相关过敏反应临床报道显示过敏体质者接种风险极高。
二、处于发热期的人群
当身体因感染等原因处于发热状态时，人体免疫系统处于应激调整阶段，此时接种九价疫苗可能无法达到预期的免疫效果，且发热本身可能掩盖疫苗接种后的不良反应，还可能加重身体不适，临床观察发现发热时接种疫苗会影响免疫应答过程。
三、妊娠期女性
妊娠期女性接种九价HPV疫苗的安全性数据尚不充分，目前临床不建议妊娠期女性接种，因为疫苗中的成分可能通过胎盘对胎儿产生未知影响，为避免潜在风险，妊娠期应避免接种九价疫苗。
四、免疫功能低下者
如患有艾滋病等免疫缺陷疾病，或长期服用免疫抑制剂（如器官移植后需长期服用的某些药物）的人群，其自身免疫系统功能受损，接种九价疫苗后难以产生有效抗体，免疫应答较差，无法起到预防HPV感染的作用，相关研究表明免疫功能低下者接种疫苗保护效果显著降低。
五、正在患急性严重疾病者
当身体正处于急性严重疾病发作期，如肺炎急性期、急性心肌炎等，此时身体抵抗力极度低下，接种九价疫苗可能无法正常激发免疫反应，还可能因疫苗接种的应激导致病情加重，临床案例显示急性严重疾病期接种疫苗会干扰身体对疾病的正常应对。
六、已感染高危型HPV者
若已经感染了九价疫苗所涵盖的高危型HPV（如16、18型等），接种九价疫苗对已感染的型别无法起到治疗作用，接种意义不大，因为疫苗主要是预防未感染的HPV型别感染，对已感染型别无效。
七、过去接种HPV疫苗有严重不良反应者
若既往接种过HPV疫苗，出现过如过敏性紫癜、严重的接种部位肿胀伴随全身不适等严重不良反应，再次接种九价疫苗时发生类似严重不良反应的风险较高，基于对自身健康的考量，这类人群不宜接种。
八、哺乳期女性需谨慎评估
虽然目前认为九价疫苗经母乳传递给婴儿的风险较低，但哺乳期女性的身体状态特殊，接种后疫苗成分在体内的代谢情况对婴儿的影响尚不明确，因此需综合自身身体恢复情况、婴儿健康状况等多方面因素谨慎评估后再决定是否接种。
九、严重神经系统疾病未控制者
像未得到有效控制的癫痫、吉兰-巴雷综合征急性期等严重神经系统疾病患者，接种九价疫苗可能诱发神经系统症状加重，临床观察发现神经系统疾病不稳定时接种疫苗可能干扰神经功能，所以此类人群不能接种。
十、对HPV疫苗接种程序有特殊禁忌情况
例如按照疫苗接种程序规定，有明确的接种间隔要求，若因特殊情况未能按时接种，且不符合补种规则时，也属于不能接种的情况，因为规范的接种程序是保障免疫效果的重要前提，偏离程序可能影响最终的免疫防护作用。
