卵巢囊肿的成因包括生理性因素（如卵泡囊肿、黄体囊肿）、病理性因素（如子宫内膜异位囊肿、炎症性囊肿、肿瘤性囊肿）以及其他因素（如生活方式和环境因素）。生理性因素中卵泡囊肿与卵泡未正常破裂排卵有关、黄体囊肿与黄体持续存在相关；病理性因素里子宫内膜异位囊肿与经血逆流等有关，炎症性囊肿与盆腔炎性疾病或结核感染有关，肿瘤性囊肿中浆液性和黏液性囊腺瘤为良性，上皮性癌为恶性；其他因素中不良生活方式和环境因素会影响内分泌等增加发病风险。
一、生理性因素
（一）卵泡囊肿
女性每个月经周期都会有卵泡发育，成熟卵泡正常大小一般在18-25mm左右。如果卵泡没有正常破裂排卵，持续生长就可能形成卵泡囊肿，这是最常见的生理性卵巢囊肿类型，多见于育龄期女性，与正常的月经周期中卵泡发育、排卵的生理过程相关，一般在月经来潮后可自行消失。
（二）黄体囊肿
排卵后卵泡壁塌陷形成黄体，正常黄体直径一般不超过2-3cm。如果黄体持续存在且直径超过3cm，就形成黄体囊肿。怀孕早期也可能出现黄体囊肿，这是因为妊娠后体内激素变化，黄体继续发育所致，多数黄体囊肿可在几个月内自行消退。
二、病理性因素
（一）子宫内膜异位囊肿（巧克力囊肿）
1.发病机制
子宫内膜组织出现在卵巢上，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊内为陈旧性血液，呈巧克力样。其发生与经血逆流等因素有关，育龄期女性尤其是有过宫腔操作史（如人工流产等）、有家族遗传倾向的人群更容易发生。子宫内膜异位症患者中约有15%-40%会累及卵巢形成巧克力囊肿。
2.相关因素
遗传因素：有研究表明，子宫内膜异位囊肿具有一定的遗传易感性，如果家族中有亲属患有子宫内膜异位症，个体患病风险可能增加。
经血逆流：在行经期间，子宫内膜碎片可能通过输卵管逆流至盆腔，种植在卵巢表面并生长，逐渐形成囊肿。
免疫因素：机体的免疫功能异常时，对异位的子宫内膜组织清除能力下降，也容易导致子宫内膜异位囊肿的形成。
（二）炎症性囊肿
1.输卵管卵巢脓肿
盆腔炎症累及卵巢和输卵管，可形成炎性包块，即输卵管卵巢脓肿。常见于性传播疾病如淋病奈瑟菌、衣原体感染等引起的盆腔炎性疾病。性生活活跃的育龄期女性是高发人群，尤其是不注意性生活卫生、有多个性伴侣的女性，炎症长期刺激卵巢，导致局部组织增生、包裹形成囊肿。
2.盆腔结核累及卵巢
结核杆菌感染盆腔，可蔓延至卵巢，引起卵巢结核，进而形成囊肿。多发生于有结核病史或与结核患者密切接触的人群，结核杆菌感染后在卵巢部位繁殖，破坏卵巢组织形成囊肿样改变。
（三）肿瘤性囊肿
1.浆液性囊腺瘤
是最常见的卵巢良性肿瘤，由单层立方上皮或柱状上皮覆盖的浆液性囊壁组成。其发生可能与卵巢上皮的异常增生有关，具体机制尚不完全明确，但好发于30-40岁女性，可单侧或双侧发生。
2.黏液性囊腺瘤
由黏液性上皮覆盖的囊壁组成，多为单侧，体积较大。其发病与卵巢黏液性上皮的异常分泌、潴留有关，多见于30-50岁女性，肿瘤生长缓慢，随着肿瘤增大可能出现腹胀等压迫症状。
3.卵巢上皮性癌
是卵巢恶性肿瘤中最常见的类型，发病机制较为复杂，可能与遗传因素（如BRCA1/BRCA2基因突变等）、长期的炎症刺激、内分泌因素等有关。好发于绝经后女性，但近年来发病年龄有年轻化趋势，其发生是多步骤的细胞癌变过程，正常卵巢上皮细胞逐渐发生基因变异，增殖失控形成肿瘤性囊肿。
三、其他因素
（一）生活方式因素
长期的不良生活方式可能影响内分泌功能，从而增加卵巢囊肿的发生风险。例如长期熬夜、过度劳累会打乱人体的生物钟，影响激素的正常分泌节律；长期精神压力过大，会通过下丘脑-垂体-卵巢轴影响激素分泌，导致内分泌紊乱，增加卵巢囊肿的发病几率。
（二）环境因素
长期接触某些环境污染物，如工业化学物质等，可能对卵巢组织产生不良影响，干扰卵巢的正常生理功能，增加卵巢囊肿的发生风险。另外，不合理的饮食结构，如长期摄入高胆固醇食物等，也可能与卵巢囊肿的发生有一定关联。
