巧克力囊肿的发病与经血逆流种植、体腔上皮化生、内分泌因素、环境因素等有关，女性生理结构、免疫、盆腔腹膜、遗传、雌激素水平、环境污染物等均在其中起作用，如女性生理结构异常、免疫功能异常、盆腔腹膜受刺激、有家族遗传史、雌激素水平过高、接触环境污染物等都可能增加患病风险。
一、经血逆流种植
1.女性生理结构相关因素
正常情况下，子宫内膜种植在子宫腔内，但在月经期间，部分经血可能会逆流。女性的输卵管是与腹腔相通的，月经血中包含子宫内膜细胞，这些细胞有可能通过输卵管逆流到盆腔内。对于有先天性生殖道畸形（如阴道横隔、处女膜闭锁等）的女性，经血流出不畅，更容易导致经血逆流。例如，处女膜闭锁的女性，月经血无法正常排出，积聚在阴道甚至宫腔内，增加了经血逆流进入盆腔的几率，进而使得子宫内膜细胞有更多机会种植在卵巢等盆腔器官表面，逐渐形成巧克力囊肿。
从年龄角度看，生育期女性是巧克力囊肿的高发人群，这与生育期女性月经周期规律，经血有正常周期性排出相关，而青春期前女性由于生殖系统尚未完全发育成熟，很少发生巧克力囊肿；绝经后女性由于卵巢功能衰退，激素水平变化，也较少出现该疾病。
2.免疫因素影响
人体的免疫系统在清除异位的子宫内膜细胞方面起着重要作用。如果免疫系统功能出现异常，比如免疫监视功能低下，就无法有效地识别和清除逆流到盆腔的子宫内膜细胞。一些自身免疫性疾病患者，其免疫系统处于紊乱状态，发生巧克力囊肿的风险可能会增加。例如，患有系统性红斑狼疮的女性，自身免疫功能异常，对异位子宫内膜细胞的清除能力下降，使得子宫内膜细胞能够在盆腔内持续生长，最终形成巧克力囊肿。
二、体腔上皮化生
1.盆腔腹膜相关情况
盆腔腹膜具有潜在的向子宫内膜样组织分化的能力。在某些因素刺激下，盆腔腹膜的体腔上皮可能会化生为子宫内膜样组织。例如，长期的炎症刺激，如盆腔炎性疾病反复发作，会导致盆腔腹膜处于慢性炎症状态，炎症因子的刺激可能促使体腔上皮发生化生。慢性盆腔炎患者由于盆腔内长期存在炎症，腹膜不断受到炎症因子的影响，增加了体腔上皮化生为子宫内膜样组织的可能性，这些化生的组织如果种植在卵巢表面等部位，就可能逐渐发展为巧克力囊肿。
从生活方式方面来看，长期吸烟的女性，烟草中的有害物质可能会影响盆腔腹膜的正常生理功能，干扰体腔上皮的正常分化过程，使体腔上皮化生的风险增加。吸烟会导致体内氧化应激增加，影响细胞的正常代谢和分化，进而对盆腔腹膜的体腔上皮产生不良影响，增加巧克力囊肿的发病几率。
2.遗传因素影响
巧克力囊肿具有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属患有巧克力囊肿，那么个体患病的风险会相对较高。研究发现，某些基因的突变或多态性与巧克力囊肿的发病相关。例如，与子宫内膜异位症相关的一些基因，如芳香化酶基因等，在有家族遗传倾向的人群中，其突变率可能会高于普通人群。如果家族中有女性患有巧克力囊肿，其他女性成员需要更加关注自身盆腔健康，定期进行妇科检查，以便早期发现可能出现的巧克力囊肿相关病变。对于有家族遗传史的女性，在青春期后就应开始关注月经情况和盆腔健康，一旦出现痛经进行性加重、盆腔包块等可疑症状，应及时就医检查。
三、其他因素
1.内分泌因素
雌激素水平过高是巧克力囊肿发病的重要因素之一。雌激素可以促进子宫内膜的生长，异位的子宫内膜组织在雌激素的作用下会不断生长、出血。在排卵后，卵巢黄体形成，分泌大量雌激素和孕激素，这一时期异位的子宫内膜组织受到雌激素刺激会增生明显。长期雌激素水平异常升高，比如患有多囊卵巢综合征的女性，由于体内内分泌紊乱，雌激素水平持续偏高，更容易促使异位的子宫内膜组织生长，增加巧克力囊肿的发生风险。多囊卵巢综合征患者常伴有月经不调、排卵障碍等问题，其体内雌激素水平波动较大且总体偏高，使得异位子宫内膜组织持续受到刺激，逐渐发展为巧克力囊肿。
从年龄和性别角度，育龄女性本身雌激素处于相对活跃的阶段，若内分泌调节出现紊乱，就更容易受到雌激素水平异常的影响。而男性由于体内雌激素水平远低于女性，基本不会患巧克力囊肿，这也从侧面反映了内分泌因素中雌激素水平对女性巧克力囊肿发病的重要性。
2.环境因素
长期接触某些环境污染物也可能与巧克力囊肿的发生有关。例如，长期接触含有多氯联苯、有机氯农药等环境污染物的女性，这些物质可能会干扰体内的内分泌平衡。研究表明，环境污染物可以通过影响激素代谢相关酶的活性，进而影响雌激素的代谢过程，导致雌激素水平失衡。在一些工业污染较为严重的地区，当地女性接触环境污染物的机会较多，患巧克力囊肿的几率可能会相对升高。对于生活在污染地区的女性，应尽量减少与环境污染物的接触，比如选择环保的生活方式，使用环保产品等，以降低巧克力囊肿的发病风险。同时，在日常生活中，要注意保持良好的生活环境，减少接触可能的有害污染物。
