肝囊肿与肝癌在影像学表现、血清学标志物及病理学方面存在差异。肝囊肿影像学上超声为边界清晰无回声区、CT呈圆形低密度影且增强无强化、MRI呈T1低信号T2高信号；血清学标志物通常无特异性改变，病理是囊壁由单层上皮细胞组成、囊内为清亮液体且周围肝组织无恶性特征。肝癌超声有结节且有血流信号、CT呈“快进快出”强化特点、MRI呈T1低信号T2稍高信号等；血清学标志物中AFP等可异常升高；肝细胞癌病理见癌细胞巢状等排列且有异型性，肝内胆管细胞癌病理呈腺管状排列且有异型性。
一、影像学表现差异
（一）肝囊肿
1.超声表现：典型肝囊肿在超声下表现为边界清晰的无回声区，后壁及后方回声增强，囊肿内部透声好，通常为单房或多房，大小不一，与年龄、生活方式等因素相关，如长期饮酒可能影响肝脏状态，但对肝囊肿超声表现影响主要是其作为基础疾病可能伴随肝脏实质改变，但肝囊肿本身超声特征相对固定。
2.CT表现：平扫呈圆形或类圆形低密度影，CT值接近水，边界锐利，增强扫描无强化，其影像学特征不受性别明显影响，不同生活方式下只要肝囊肿本身无特殊变化，CT表现相对稳定，病史方面若既往无特殊肝脏严重病变，肝囊肿CT表现典型。
3.MRI表现：T1加权像呈低信号，T2加权像呈高信号，且信号均匀，与周围肝组织界限清楚，年龄较小患者肝囊肿MRI表现与成人无本质差异，生活方式影响主要通过肝脏整体状态间接影响，病史中无肝脏恶性肿瘤等基础疾病时更符合单纯肝囊肿的MRI表现。
（二）肝癌
1.超声表现：肝癌超声多表现为低回声、高回声或混合回声结节，边界常不清晰，可有晕环，彩色多普勒超声可见血流信号，动脉期多有明显强化等特征，年龄对超声下肝癌表现影响不大，性别差异不显著，生活方式中长期酗酒、病毒性肝炎患者等高危人群更易患肝癌，此时超声下肝癌表现可能因基础疾病影响肝脏背景，但肝癌本身超声特征主要与肿瘤生物学行为相关。
2.CT表现：平扫多为低密度灶，增强扫描动脉期快速强化，门静脉期或延迟期快速廓清，呈现“快进快出”的强化特点，不同年龄患者肝癌CT表现虽有一定差异，但主要还是取决于肿瘤病理类型等，性别因素对CT表现影响不突出，有肝炎病史、长期食用霉变食物等生活方式的人群患肝癌风险高，其CT表现符合肝癌强化特点。
3.MRI表现：T1加权像多为低信号，T2加权像为稍高信号，增强扫描动脉期强化，门静脉期或延迟期廓清，弥散加权成像（DWI）上多呈高信号，年龄较小患者患肝癌相对少见，但表现符合上述强化特点，女性患者患肝癌风险相对男性可能较低，但MRI表现主要由肿瘤特性决定，生活方式中暴露于肝癌危险因素的人群更易出现相应MRI表现。
二、血清学标志物差异
（一）肝囊肿
血清学标志物通常无特异性改变，肝功能一般正常或轻度异常，甲胎蛋白（AFP）等肝癌相关标志物无明显升高，年龄不同肝囊肿患者血清学标志物变化主要与肝囊肿是否引起肝脏轻微炎症等相关，女性和男性肝囊肿患者血清学标志物差异不显著，生活方式中健康生活方式者肝囊肿相关血清学标志物更接近正常，有基础肝病但非肝癌时血清学标志物也无肝癌相关特异性升高。
（二）肝癌
1.甲胎蛋白（AFP）：AFP是诊断肝癌的重要血清学标志物，多数肝癌患者AFP升高，尤其是肝细胞癌，但也有部分肝癌患者AFP正常，年龄较小患者患肝癌时AFP变化需结合具体病情，儿童肝癌相对少见，但若发生AFP可异常升高，女性肝癌患者AFP变化无性别特异性差异，生活方式中长期接触黄曲霉毒素、有病毒性肝炎感染史等人群AFP更易出现异常升高，病史中有慢性肝炎、肝硬化等基础疾病者AFP升高提示肝癌可能。
2.其他血清学标志物：如异常凝血酶原（PIVKA-Ⅱ）等，在肝癌患者中也可升高，其变化同样受年龄、性别影响较小，主要与肝癌肿瘤细胞产生相关物质有关，生活方式和病史中符合肝癌高危因素的人群这些标志物更易异常。
三、病理学差异
（一）肝囊肿
肝囊肿的病理表现为囊壁由单层扁平上皮细胞或立方上皮细胞组成，囊内为清亮液体，周围肝组织无明显恶性肿瘤细胞特征，不同年龄肝囊肿患者病理表现相似，性别不影响其病理结构，生活方式中无论何种生活方式，肝囊肿病理本质是囊腔形成，病史中无肿瘤相关病理改变。
（二）肝癌
1.肝细胞癌：病理上可见癌细胞呈巢状、梁索状排列，癌细胞有异型性，核大、深染，可见核分裂象，不同年龄肝细胞癌患者病理表现主要是细胞异型程度等有差异，儿童肝细胞癌病理特征与成人有一定不同但都符合恶性肿瘤细胞特点，性别差异不体现在病理结构上，生活方式中高危因素人群肝细胞癌病理更具侵袭性等特点，病史中有基础肝病者肝癌病理更易出现浸润等恶性表现。
2.肝内胆管细胞癌：病理表现为癌细胞呈腺管状排列，可伴有黏液分泌，癌细胞异型性也较明显，年龄、性别对其病理结构影响不大，生活方式和病史中相关因素促使其形成相应病理特征。
