克罗恩病有消化系统表现，如多数患者有腹痛（多在右下腹或脐周，有间歇性发作转为持续性钝痛等特点）、腹泻（粪便多糊状，病变累及结肠下段或直肠可有黏液血便，频率因人而异）、约10%-20%患者可触及腹部包块（因肠粘连等所致）；有全身表现，部分患者发热（低热、中度热或高热，与肠道炎症活动或继发感染有关）、病程长或病情严重者有营养不良（体重减轻等）；还有肠外表现，如口腔黏膜溃疡、关节症状（外周关节炎，大关节受累）、皮肤病变（结节性红斑、坏疽性脓皮病等）。
多数患者有腹痛表现，多位于右下腹或脐周，呈间歇性发作，常为痉挛性阵痛伴腹鸣。随着病情进展，腹痛可转为持续性钝痛。不同年龄人群腹痛特点可能有差异，儿童患者腹痛可能更易被忽视或表现不典型。例如，一些儿童可能仅表现为腹部不适、哭闹等非特异性表现。
腹痛的发生与肠道炎症、肠道痉挛等有关，炎症导致肠道黏膜受损，神经受到刺激，同时肠道蠕动异常引发痉挛，从而产生疼痛。
腹泻
是常见症状之一，粪便多为糊状，一般无脓血或黏液，但病变累及结肠下段或直肠时，可有黏液血便。腹泻的频率因人而异，轻者每日2-3次，重者可达每日10余次。不同年龄阶段人群腹泻表现有别，成年患者可能能较清晰表述腹泻情况，而婴幼儿患者可能表现为排便次数增多、大便性状改变等。
腹泻主要是由于肠道炎症引起肠道吸收功能障碍、分泌增加以及肠道蠕动加快等多种因素导致。肠道炎症使黏膜对水分和电解质的吸收能力下降，同时炎症刺激肠道分泌过多液体，加上肠道蠕动亢进，使得大便次数增多、性状改变。
腹部包块
约10%-20%的患者可触及腹部包块，多位于右下腹与脐周，因肠粘连、肠壁增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成等所致。不同年龄人群腹部包块的发现难度不同，儿童患者由于腹部脂肪相对较少，可能相对容易触及包块，但也可能因患儿不配合等因素增加发现难度。
当肠道发生炎症反应时，周围组织可能出现粘连、增生等情况，形成包块样结构。
全身表现
发热
部分患者会出现发热，可为低热或中度热，少数呈高热。发热多与肠道炎症活动或继发感染有关。不同年龄患者发热特点有差异，儿童患者发热可能更易波动，且由于儿童体温调节中枢发育不完善等因素，发热表现可能不如成人典型，有时可能仅表现为体温轻度升高或伴有精神状态改变等。
肠道炎症部位的免疫反应会释放炎性介质，如白细胞介素-1、肿瘤坏死因子等，这些炎性介质作用于体温调节中枢，导致体温升高。如果同时合并感染，如肠道继发细菌感染等，也会引起发热。
营养不良
多见于病程较长或病情严重的患者，表现为体重减轻、消瘦、贫血、低蛋白血症等。儿童患者若发生克罗恩病，营养不良会严重影响其生长发育，导致身高、体重增长迟缓等。因为肠道炎症影响营养物质的消化、吸收，患者摄入的营养不能充分被利用，同时可能存在食欲减退等情况，进一步加重营养不良。
肠外表现
口腔黏膜病变
部分患者可出现口腔黏膜溃疡，如阿弗他溃疡等。不同年龄人群口腔黏膜病变的表现可能相似，但儿童患者由于口腔卫生等因素的影响，可能会有一些不同的表现或护理上的特殊注意事项。例如，儿童可能更易因口腔不适而影响进食。
口腔黏膜病变的发生与克罗恩病的全身炎症状态有关，炎症反应累及口腔黏膜相关组织，导致黏膜受损出现溃疡等病变。
关节症状
可出现外周关节炎，以大关节受累为主，如膝关节、踝关节等，表现为关节肿胀、疼痛、活动受限等。不同年龄患者关节症状的严重程度和对生活的影响不同，儿童患者关节受累可能影响其行走、运动等功能，需要特别关注其活动能力和生长发育过程中的关节情况。
关节症状的发生机制可能与自身免疫反应有关，克罗恩病患者体内的自身抗体等免疫因素可能攻击关节组织，导致关节炎性病变。
皮肤表现
可出现结节性红斑、坏疽性脓皮病等皮肤病变。结节性红斑表现为下肢伸侧的红色结节，有压痛；坏疽性脓皮病表现为皮肤溃疡等。不同年龄人群皮肤表现的特点有所不同，儿童患者皮肤相对娇嫩，皮肤病变可能对其皮肤外观和心理产生影响，需要关注皮肤护理和心理支持等方面。
皮肤病变也是全身炎症反应的一种外在表现，炎症介质等通过血液循环影响皮肤组织，导致皮肤出现相应的病变。
