生化妊娠的原因包括胚胎因素（胚胎染色体异常常见）、母体因素（内分泌因素如黄体功能不全、甲状腺功能异常，子宫因素如解剖结构异常、子宫内膜病变）、免疫因素（自身免疫异常等）、生活方式因素（长期吸烟酗酒、过度肥胖或消瘦等）、环境因素（长期接触有害化学物质或高辐射环境等）。
一、胚胎因素
胚胎染色体异常是导致生化妊娠最常见的原因之一。大量研究表明，约50%-60%的生化妊娠是由于胚胎染色体数目或结构异常所致。例如，在自然受孕的早期胚胎中，染色体异常的发生率较高，这种异常会使胚胎无法正常发育，从而导致生化妊娠的发生。无论是男性精子携带的染色体异常还是女性卵子携带的染色体异常，都可能引发胚胎染色体异常情况。
二、母体因素
（一）内分泌因素
1.黄体功能不全：女性黄体期分泌的孕激素不足会影响子宫内膜的容受性，使得子宫内膜不能很好地支持胚胎的着床和发育。研究发现，黄体功能不全的女性发生生化妊娠的风险明显升高。例如，体内孕酮水平低于正常生理值时，子宫内膜的形态和功能会出现异常，不利于胚胎着床，进而导致生化妊娠。
2.甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进都会对妊娠产生不利影响。甲状腺激素参与人体多种代谢过程，甲状腺功能减退时，机体内分泌环境紊乱，会影响子宫内膜的状态和胚胎的发育；甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎的正常着床和发育，增加生化妊娠的发生几率。
（二）子宫因素
1.子宫解剖结构异常：如子宫畸形（如纵隔子宫、双角子宫等）会改变子宫腔内的环境，影响胚胎的着床位置和着床后的发育。纵隔子宫会使宫腔空间受到分隔，胚胎着床时可能无法获得足够的营养和适宜的环境，从而容易发生生化妊娠。
2.子宫内膜病变：子宫内膜炎、子宫内膜息肉等病变会影响子宫内膜的厚度和容受性。子宫内膜炎会导致子宫内膜出现炎症反应，破坏子宫内膜的正常结构和功能；子宫内膜息肉会占据宫腔内的空间，干扰胚胎的着床，这些情况都可能引发生化妊娠。
三、免疫因素
自身免疫异常可能导致生化妊娠。例如，抗磷脂抗体综合征患者，体内存在抗磷脂抗体，这种抗体可影响胎盘的血管形成，导致胎盘血流灌注不足，胚胎得不到充足的血液供应而无法正常发育，进而引发生化妊娠。此外，母体的免疫系统对胚胎产生过度的免疫排斥反应，也会使胚胎无法在子宫内正常着床和发育，增加生化妊娠的发生风险。
四、生活方式因素
长期吸烟、酗酒会对生殖系统产生不良影响。吸烟会影响卵子和精子的质量，增加染色体异常的发生几率；酗酒会干扰内分泌系统，影响激素的正常分泌，从而影响胚胎的着床和发育。另外，过度肥胖或过度消瘦也可能导致内分泌紊乱，影响妊娠结局，增加生化妊娠的发生可能性。肥胖女性往往存在胰岛素抵抗等问题，会影响子宫内膜的容受性；过度消瘦的女性可能存在营养不良等情况，也不利于胚胎的正常发育。
五、环境因素
长期接触某些有害化学物质，如苯、甲醛等，或者处于高辐射环境中，都可能对生殖细胞和胚胎发育产生不良影响。这些环境因素可能会导致胚胎染色体突变、子宫内膜损伤等，进而引发生化妊娠。例如，在一些化工企业工作的女性，如果长期暴露在有害化学物质环境中，其发生生化妊娠的风险会高于正常人群。
