生化妊娠受多种因素影响，包括精子或卵子染色体异常、子宫畸形、黄体功能不全等。
1.精子或卵子染色体异常
正常的妊娠需要精子和卵子携带的染色体都处于正常状态，才能保证受精卵的正常发育。如果精子或者卵子的染色体存在数目或者结构的异常，那么形成的受精卵就很可能存在染色体异常的情况，从而导致生化妊娠。
2.子宫畸形
如单角子宫、双角子宫等。子宫的解剖结构异常会影响受精卵的着床环境，使得受精卵难以正常着床并发育，从而增加生化妊娠的发生风险。例如，双角子宫由于宫腔形态异常，可能会导致受精卵着床位置不佳，影响其正常的生长发育过程。
3.黄体功能不全
黄体分泌的孕酮对于维持子宫内膜的容受性和妊娠的继续非常重要。黄体功能不全时，黄体分泌的孕酮水平不足，子宫内膜不能很好地转化，从而影响受精卵的着床和发育。例如，正常情况下，黄体期子宫内膜应该处于分泌期，为受精卵着床做好准备，而黄体功能不全的女性，子宫内膜分泌期变化不充分，使得受精卵难以着床，导致生化妊娠的发生。
